RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 A0A1B0GTH9 108 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 MEIOCA2RUB1 952 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 SERINC4A6NH21 518 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 HMGN4O00479 90 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 AIREO43918 545 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 CST1P01037 141 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 ITGB2P05107 769 aa8□□□□□ -1.13
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GGA3-202ENST00000538886 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 KDELR2P33947 212 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 SOX6P35712 828 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 KLRB1Q12918 225 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 SLC36A3Q495N2 470 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 SLC6A19Q695T7 634 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 PAMR1Q6UXH9 720 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 NEURL3Q96EH8 262 aa8□□□□□ -1.13
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GGA3-202ENST00000538886 RADILQ96JH8 1075 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 HSH2DQ96JZ2 352 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 WACQ9BTA9 647 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 ZFP64Q9NPA5 681 aa8□□□□□ -1.13
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GGA3-202ENST00000538886 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 A0A0G2JPF8 293 aa8□□□□□ -1.13
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GGA3-202ENST00000538886 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 KLK4Q9Y5K2 254 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 FRG2CA6NGY1 282 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 AK1P00568 194 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 ATP4BP51164 291 aa8□□□□□ -1.13
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GGA3-202ENST00000538886 LINC00518Q8N0U6 118 aa8□□□□□ -1.13
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GGA3-202ENST00000538886 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8□□□□□ -1.13
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GGA3-202ENST00000538886 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 STX12Q86Y82 276 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.99□□□□□ -1.13
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GGA3-202ENST00000538886 GHITMQ9H3K2 345 aa7.99□□□□□ -1.13
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