RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516810.1

RNU6-1149P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1149, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1149P, Length 97 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1149P-201ENST00000516810 CUL1Q13616 776 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 CARTPTQ16568 116 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 TYSND1Q2T9J0 566 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 HFEQ30201 348 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 TTLL9Q3SXZ7 439 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 FAM74A3Q4VXF1 159 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 C16orf54Q6UWD8 224 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 CES3Q6UWW8 571 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 LINC00696Q6ZRV3 163 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 C16orf62Q7Z3J2 963 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 NT5DC3Q86UY8 548 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 SYCP3Q8IZU3 236 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 FBXL13Q8NEE6 735 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 IPMKQ8NFU5 416 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 LINC01560Q8TB33 94 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 CNIH3Q8TBE1 160 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 PKMYT1Q99640 499 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 CENPOQ9BU64 300 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 SMYD3Q9H7B4 428 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 YY1AP1Q9H869 796 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 FOLH1BQ9HBA9 442 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 NEK6Q9HC98 313 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 GLRX2Q9NS18 164 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 NUDT15Q9NV35 164 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 NDUFA13Q9P0J0 144 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 FBXW2Q9UKT8 454 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 STX8Q9UNK0 236 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 SIGLEC7Q9Y286 467 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 CCDC7Q96M83 1385 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 LRRC30A6NM36 301 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 RHOBTB1O94844 696 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 SMIM10L1P0DMW3 83 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 UQCRBP14927 111 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 NPR2P20594 1047 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 CYP2B6P20813 491 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 RFC4P35249 363 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 LEPP41159 167 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 CXCL12P48061 93 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 CYB561P49447 251 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 RBP5P82980 135 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 PARP15Q460N3 678 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 DEFB134Q4QY38 66 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 GPRC6AQ5T6X5 926 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 HES5Q5TA89 166 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 AP1ARQ63HQ0 302 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 ZFP1Q6P2D0 407 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 Q6ZN92 141 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 TMEM136Q6ZRR5 245 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 NLRP9Q7RTR0 991 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 VSTM4Q8IW00 320 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 BATF2Q8N1L9 274 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 SFRP1Q8N474 314 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 TMEM105Q8N8V8 129 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 LEMD2Q8NC56 503 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 OR13G1Q8NGZ3 307 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 C17orf50Q8WW18 174 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 TM4SF18Q96CE8 201 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 SMIM10Q96HG1 83 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 ZNF607Q96SK3 696 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 FTHL17Q9BXU8 183 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 IL26Q9NPH9 171 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 A0A0U1RRA0 63 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 ZNF320A2RRD8 509 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 VSTM2BA6NLU5 285 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 A8MUI8 341 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 E7EQL1 145 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 DCTN6O00399 190 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 PSMA7O14818 248 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 SH3BP5O60239 455 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 KLHL2O95198 593 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 TCP1P17987 556 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 YWHABP31946 246 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 DEFB103AP81534 67 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 SLC7A9P82251 487 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 BFSP1Q12934 665 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 IFT88Q13099 833 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 TOMM20Q15388 145 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 ZBED5Q49AG3 693 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 ATL3Q6DD88 541 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 LCN12Q6JVE5 192 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1149P-201ENST00000516810 ACSM5Q6NUN0 579 aa0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms