RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	APH1A	Q96BI3	265 aa		15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	DACH2	Q96NX9	599 aa		15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	ADA	P00813	363 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	GGT1	P19440	569 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	GRPR	P30550	384 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	KDM8	Q8N371	416 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	ASPN	Q9BXN1	380 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	RASD1	Q9Y272	281 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		15.73	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902		M0R082	166 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	VAMP5	O95183	116 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	THY1	P04216	161 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	IFNW1	P05000	195 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	IL32	P24001	234 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	EDNRA	P25101	427 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	CCKAR	P32238	428 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	IFNA8	P32881	189 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	PCYT1A	P49585	367 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	TSC22D1	Q15714	1073 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	IFI44L	Q53G44	452 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	CBLL1	Q75N03	491 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	AAED1	Q7RTV5	226 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	MPP4	Q96JB8	637 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	LURAP1	Q96LR2	239 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		15.72	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902		A6NNC1	897 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	LRRN3	E7EW58	273 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	OR5F1	O95221	314 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	LYPD3	O95274	346 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	ZNF43	P17038	809 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	CALB2	P22676	271 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	NTF4	P34130	210 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	PMS2P3	Q13401	168 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZT83	130 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	UPB1	Q9UBR1	384 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		15.71	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	AKAP6	Q13023	2319 aa		15.71	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	PDZD2	O15018	2839 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	LYZL6	O75951	148 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	KRT33A	O76009	404 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	CH25H	O95992	272 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	BGLAP	P02818	100 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	UMPS	P11172	480 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	HSD17B1	P14061	328 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	P2RY4	P51582	365 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP10-9	P60411	292 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	LTB	Q06643	244 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	FAP	Q12884	760 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	ITGAD	Q13349	1161 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	P2RY6	Q15077	328 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	POU4F3	Q15319	338 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms