RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-204ENST00000461653 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-204ENST00000461653 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 LILRA5A6NI73 299 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 A8MUA0 341 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM50AO95807 157 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 CD82P27701 267 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 STX17P56962 302 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 OR1D5P58170 312 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 NTHL1P78549 312 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 LCN2P80188 198 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 RAD51Q06609 339 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 GTF2H2Q13888 395 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE2V2Q15819 145 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP1R3AQ16821 1122 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 ASPRV1Q53RT3 343 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 DDI2Q5TDH0 399 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 H3F3CQ6NXT2 135 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 C8orf74Q6P047 294 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 SCYL2Q6P3W7 929 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 LEG1Q6P5S2 330 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM171BQ6P995 826 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 PAQR6Q6TCH4 344 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 GFRALQ6UXV0 394 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 ASB18Q6ZVZ8 466 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM219Q86XT9 240 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 TIAM2Q8IVF5 1701 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC50Q8IVM0 306 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC35F2Q8IXU6 374 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 MARVELD2Q8N4S9 558 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC185Q8N715 623 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 GATSQ8NAP1 163 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 OR52I1Q8NGK6 324 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 OR4A4PQ8NGN8 299 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 CDKL2Q92772 493 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 PNPLA2Q96AD5 504 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 SYT11Q9BT88 431 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM121Q9BTD3 319 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 FKRPQ9H9S5 495 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 POPDC2Q9HBU9 364 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 NRN1Q9NPD7 142 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 PEX16Q9Y5Y5 336 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 THSD7BQ9C0I4 1608 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1W2PNV4 684 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 FBP2O00757 339 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 TAPBPO15533 448 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 PRKAB2O43741 272 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP5HO75947 161 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 MYO1DO94832 1006 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 TOXO94900 526 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 AMBPP02760 352 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 PRSS1P07477 247 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 AOC1P19801 751 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 GCAP28676 217 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 GNA11P29992 359 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 RGRP47804 291 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 RFX3P48380 749 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 POU3F4P49335 361 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 FHITP49789 147 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 STK19P49842 368 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 HMGCS2P54868 508 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE2G2P60604 165 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 RPL27P61353 136 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 ERVK-25P63136 954 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 MYL7Q01449 175 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 GUCY2DQ02846 1103 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 RGS1Q08116 209 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 KLRB1Q12918 225 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 PON2Q15165 354 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF74Q16587 644 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 DUSP5Q16690 384 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC25A52Q3SY17 297 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 FGD3Q5JSP0 725 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR107Q5VW38 600 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 RNLSQ5VYX0 342 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 GCNT7Q6ZNI0 430 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 NFE4Q86UQ8 179 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 ERICH1Q86X53 443 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 GPC2Q8N158 579 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 B3GNT7Q8NFL0 401 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 NEURL2Q9BR09 285 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 CHID1Q9BWS9 393 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 COMMD4Q9H0A8 199 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-204ENST00000461653 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms