RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389757.7

PKP4-201, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 5,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-201ENST00000389757 AMY2AP04746 511 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 NID1P14543 1247 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 PRR18Q8N4B5 295 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 C12orf49Q9H741 205 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ASB1Q9Y576 335 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 STK17BO94768 372 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ARSBP15848 533 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 BSGP35613 385 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ZNF91Q05481 1191 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 PLGLAQ15195 96 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 OR7G2Q8NG99 324 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 KCNE4Q8WWG9 221 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 MFRPQ9BY79 579 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 SYNPO2LQ9H987 977 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 COL4A1P02462 1669 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 MFAP5Q13361 173 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ZNF691Q5VV52 312 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ARSKQ6UWY0 536 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 SLC35A4Q96G79 324 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 TEX37Q96LM6 180 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 NMNAT3Q96T66 252 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 NELFAQ9H3P2 528 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 KRBA1A5PL33 1030 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 KLK10O43240 276 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 FPR3P25089 353 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 SLC22A6Q4U2R8 563 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 SLC43A2Q8N370 569 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 COQ8AQ8NI60 647 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 SGCZQ96LD1 299 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 CITED4Q96RK1 184 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ALG5Q9Y673 324 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 THBS1P07996 1170 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 PPIAP62937 165 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 TCEAL3Q969E4 200 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 TMEM72A0PK05 275 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 MPPED1O15442 326 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 VAMP5O95183 116 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 IL2RAP01589 272 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 GABRR1P24046 479 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 TCTN1Q2MV58 587 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ZNF683Q8IZ20 524 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 CMTM1Q8IZ96 169 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ZNF610Q8N9Z0 462 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 OR5M1Q8NGP8 315 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 NT5CQ8TCD5 201 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 K7EQS6 105 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 GPRIN2O60269 458 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 KCNK2O95069 426 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 SLC1A3P43003 542 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 SPOCK1Q08629 439 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 NTRK2Q16620 822 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 MED20Q9H944 212 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 A0A087WV62 115 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 LCN1P31025 176 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 DRD3P35462 400 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 GABRA2P47869 451 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 FOXK2Q01167 660 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 RUNX2Q13950 521 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 LILRA2Q8N149 483 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 NIPAL2Q9H841 368 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 V9GY05 133 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 B4DXG7 233 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 OR2J2O76002 312 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 AKR7A3O95154 331 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 YES1P07947 543 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 OR2T7P0C7T2 308 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 AKR1C4P17516 323 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 PRKACBP22694 351 aa9.46□□□□□ -0.89
PKP4-201ENST00000389757 BMXP51813 675 aa9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms