RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 SDF2Q99470 211 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 GPER1Q99527 375 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 SLC6A17Q9H1V8 727 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 SLC6A20Q9NP91 592 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ZFP64Q9NPA5 681 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 WASH6PQ9NQA3 447 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 CA10Q9NS85 328 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 UPB1Q9UBR1 384 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 DSPPQ9NZW4 1301 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 CBX7O95931 251 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 F3P13726 295 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 P2RY2P41231 377 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 GPR139Q6DWJ6 353 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 PRR22Q8IZ63 422 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF101Q8IZC7 436 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 LINC01555Q8NAE3 123 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 PLPP7Q8NBV4 271 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 KCNK15Q9H427 330 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 FADS1O60427 444 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 PRAF2O60831 178 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF28P17035 718 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 UBE2NLQ5JXB2 153 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 OR10K2Q6IF99 312 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 GHITMQ9H3K2 345 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 DOCK4Q8N1I0 1966 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 CHD5Q8TDI0 1954 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 MEIKINA0A087WXM9 373 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 IMPA2O14732 288 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 LPLP06858 475 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 RHOUQ7L0Q8 258 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM17Q86X19 198 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 OR2L3Q8NG85 312 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 OR52R1Q8NGF1 315 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 NR4A3Q92570 626 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 MED17Q9NVC6 651 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 GPR34Q9UPC5 381 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ERVK-19Q9WJR5 959 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 FITM1A5D6W6 292 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 RDH16O75452 317 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 TFPIP10646 304 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PSMA3P25788 255 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CD34P28906 385 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 DLSTP36957 453 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 DMRTC1Q5HYR2 192 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SLC6A19Q695T7 634 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OR6V1Q8N148 313 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PTP4A1Q93096 173 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SCMH1Q96GD3 660 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OR8D2Q9GZM6 311 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 HRASLS2Q9NWW9 162 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 NCDNQ9UBB6 729 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SYT5O00445 386 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 RENP00797 406 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PGAM2P15259 253 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SPOCK1Q08629 439 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 EOGTQ5NDL2 527 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OR2A1Q8NGT9 310 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SMARCD2Q92925 531 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 IL21RQ9HBE5 538 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CMC2Q9NRP2 79 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 NTMQ9P121 344 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 KRBOX1C9JBD0 128 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 RRASP10301 218 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PPP3CBP16298 524 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PRKAR1BP31321 381 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ABHD13Q7L211 337 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SLC51BQ86UW2 128 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 GLB1L2Q8IW92 636 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CAMKVQ8NCB2 501 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 METTL21AQ8WXB1 218 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PELI1Q96FA3 418 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 C5orf34Q96MH7 638 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 Q9N2J8 555 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ISYNA1Q9NPH2 558 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 EGFP01133 1207 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 UGT2B7P16662 529 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OR7E24Q6IFN5 339 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM64Q6YI46 380 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 MAMSTRQ6ZN01 415 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ACBD4Q8NC06 268 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 STEAP2Q8NFT2 490 aa13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms