RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 SNTA1Q13424 505 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CCDC58Q4VC31 144 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 ARMCX4Q5H9R4 360 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 OR5L2Q8NGL0 311 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 COX4I2Q96KJ9 171 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 Q96M85 177 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 GNRHR2Q96P88 292 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.96□□□□□ -0.81
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM72A0PK05 275 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 MPZL2O60487 215 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 HCN1O60741 890 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 GPANK1O95872 356 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CCL3P10147 92 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 GP1BBP13224 206 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 DCKP27707 260 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ADH7P40394 386 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ADGRG3Q86Y34 549 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CADM3Q8N126 398 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 Q96MT0 163 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CDC6Q99741 560 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 OR51E2Q9H255 320 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 TAS2R10Q9NYW0 307 aa9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 RTTNQ86VV8 2226 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 A0A0G2JMM0 328 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1W2PPB8 328 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1W2PRS3 328 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 EFCAB10A6NFE3 127 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 KIR3DP1A8MWS1 328 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SUSD5O60279 629 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 RCBTB2O95199 551 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 OCM2P0CE71 109 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 GADD45AP24522 165 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 GRPRP30550 384 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CASP3P42574 277 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 P2RX1P51575 399 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 RAB15P59190 212 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 E2F1Q01094 437 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ITGADQ13349 1161 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ATP1A4Q13733 1029 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CBFBQ13951 182 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF74Q16587 644 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 AADACL4Q5VUY2 407 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 RTL4Q6ZR62 310 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 RFLNBQ8N5W9 214 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM156Q8N614 296 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 TMCO6Q96DC7 493 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM80Q96HE8 168 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 LRFN5Q96NI6 719 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 MMP25Q9NPA2 562 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 TMED7Q9Y3B3 224 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SH3D21A4FU49 640 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 OR7A10O76100 309 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 GUSBP08236 651 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 PGCP20142 388 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 TGFBR2P37173 567 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 RFC3P40938 356 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 PTGDSP41222 190 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 GAS1P54826 345 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 FOXF1Q12946 379 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 KCNJ8Q15842 424 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CTF1Q16619 201 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 OCLNQ16625 522 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SLC6A19Q695T7 634 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SLC51BQ86UW2 128 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 LNX2Q8N448 690 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SVOPQ8N4V2 548 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ADAM19Q9H013 955 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms