RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558671.1

AC107980.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC107980.1, Length 3,355 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC107980.1-201ENST00000558671 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 OPN1SWP03999 348 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 BCHEP06276 602 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 S1PR1P21453 382 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 NT5EP21589 574 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 RFX3P48380 749 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 SOX8P57073 446 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 DCAF7P61962 342 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 SP4Q02446 784 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 ACSM1Q08AH1 577 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 LRP11Q86VZ4 500 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 TEAD3Q99594 435 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 MICU1Q9BPX6 476 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 MMP26Q9NRE1 261 aa6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 A0A1W2PPC1 479 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 SHISA3A0PJX4 238 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 ABLIM3O94929 683 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 SOD2P04179 222 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 TYRP1P17643 537 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 ITGB5P18084 799 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 RAB6AP20340 208 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 MC5RP33032 325 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 DLSTP36957 453 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 AGTR2P50052 363 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 TEAD2Q15562 447 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 C4orf17Q53FE4 359 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 ARSIQ5FYB1 569 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 Q6ZSR9 355 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 KCTD9Q7L273 389 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 BAP18Q8IXM2 172 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 WDR92Q96MX6 357 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 FKRPQ9H9S5 495 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 NEU3Q9UQ49 428 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 COL18A1P39060 1754 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 LRP5O75197 1615 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 FAM183AA6NL82 134 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 TLR5O60602 858 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 OR2J2O76002 312 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 OR2C1O95371 312 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 FGBP02675 491 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 C8GP07360 202 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 SFTPBP07988 381 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 TBPP20226 339 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 TM4SF1P30408 202 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 KIR3DL1P43629 444 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 SULT1A1P50225 295 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 RAC3P60763 192 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 SQSTM1Q13501 440 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 HERPUD1Q15011 391 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 TCEA2Q15560 299 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 ZNF626Q68DY1 528 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 RTL6Q6ICC9 239 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 NXPE1Q8N323 547 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 THAP4Q8WY91 577 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.54□□□□□ -1.36
AC107980.1-201ENST00000558671 SIPA1L1O43166 1804 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms