RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296786.7

UBLCP1-201, Transcript of ubiquitin like domain containing CTD phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBLCP1, Length 2,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1-201ENST00000296786 MAOBP27338 520 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 CD38P28907 300 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 DIO1P49895 249 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 CCR4P51679 360 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 LGALS3BPQ08380 585 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 CBLN3Q6UW01 205 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 GKN2Q86XP6 184 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 FAM71CQ8NEG0 241 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ELOA3Q8NG57 546 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 RFT1Q96AA3 541 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 RNF170Q96K19 258 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 DDOQ99489 341 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 GDF15Q99988 308 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 PDE7BQ9NP56 450 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 CLEC4AQ9UMR7 237 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 TLCD2A6NGC4 264 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 OIP5O43482 229 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 HPGDP15428 266 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ATF1P18846 271 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 SLC37A1P57057 533 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 PRPS1P60891 318 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 SKP2Q13309 424 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 SERTAD2Q14140 314 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 GPR176Q14439 515 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 KCNAB1Q14722 419 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 CDK10Q15131 360 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 TCTE1Q5JU00 501 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 NOXA1Q86UR1 476 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ZNF440Q8IYI8 595 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 GPR135Q8IZ08 494 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 OR14A2Q96R54 314 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ABHD1Q96SE0 405 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ZNF576Q9H609 170 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 UCK1Q9HA47 277 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 NCDNQ9UBB6 729 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ADAMTS20P59510 1910 aa8.5□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 CFAP54Q96N23 3096 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 A0A0B4J203 849 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 C4orf47A7E2U8 309 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 A8MUA0 341 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 H0YIG0 161 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ORC5O43913 435 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 SLC43A1O75387 559 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ARL6IP5O75915 188 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 YES1P07947 543 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 UBL4AP11441 157 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 EPXP11678 715 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ARSBP15848 533 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 EDNRAP25101 427 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 SLC6A1P30531 599 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 GRPRP30550 384 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 GALNSP34059 522 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 PSMB10P40306 273 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 AQP2P41181 271 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 NDUFA5Q16718 116 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 DEFB133Q30KQ1 61 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 SLC35D3Q5M8T2 416 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 NKAIN2Q5VXU1 208 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 LEG1Q6P5S2 330 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 APOOLQ6UXV4 268 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 ZNF527Q8NB42 609 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 OR4D9Q8NGE8 314 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.49□□□□□ -1.05
UBLCP1-201ENST00000296786 MSANTD3Q96H12 275 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms