RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cachd1Q6PDJ1 1288 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1316Q8VG12 314 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab40bQ8VHP8 278 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd209dQ91ZW8 237 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IqchQ9D2K4 1071 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ift22Q9DAI2 185 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phyhd1Q9DB26 291 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2d22Q9JKY7 500 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Deaf1Q9Z1T5 566 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SvilQ8K4L3 2170 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp1r3dA2AJW4 279 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd101A8E0Y8 1033 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr653E9PVA0 317 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1425K7N659 312 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dscr3O35075 297 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prl4a1O35256 227 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcp2P12660 120 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr2f6P43136 390 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wnt11P48615 354 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh26P59862 763 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rras2P62071 204 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Entpd6Q3U0P5 455 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd47Q61735 303 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr2mQ6P6I6 366 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ScocQ78YZ6 125 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1275Q7TQY8 312 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc29Q80VM3 471 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif4e2Q8BMB3 245 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lgi4Q8K1S1 537 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr692Q8VF03 329 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhga12Q91XY7 932 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rcbtb2Q99LJ7 551 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PigkQ9CXY9 395 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spns3Q9D232 514 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp433A0A0J9YUD4 600 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4779A0A1B0GR91 561 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm32687A0A1W2P6H7 600 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Skint4A7TZF3 474 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmed7D3YZZ5 224 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3327F7C9A1 213 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21976J3QNN2 249 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fpr-s1O08790 351 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AvpP35455 168 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map2k4P47809 397 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc9a3r1P70441 355 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl21Q3U410 597 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav8d-2Q5R1B6 112 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ParpbpQ6IRT3 573 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf182Q6P560 627 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp763Q8BIC7 588 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ston1Q8CDJ8 730 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc23Q8CHY7 488 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab38Q8QZZ8 211 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr643Q8VGY1 314 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D6Wsu163eQ91YN0 552 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taldo1Q93092 337 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcg5Q99PE8 652 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Izumo2Q9DA16 220 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B3galt5Q9JI67 308 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dkk3Q9QUN9 349 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syt11Q9R0N3 430 aa11.68□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1056A2AVY0 313 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11127A7VMS2 374 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp97E9PZP6 546 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp960L7N267 546 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scarb2O35114 478 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Galr3O88853 370 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il13P20109 131 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IapP24822 559 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wbp1P97764 304 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thbs2Q03350 1172 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pik3ip1Q7TMJ8 264 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef4Q7TNR9 484 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinb9fQ80UK5 377 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc5a7Q8BGY9 580 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc41a3Q921R8 488 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med18Q9CZ82 208 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pex13Q9D0K1 405 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acox3Q9EPL9 700 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr44Q9EQB8 314 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgf20Q9ESL9 211 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a21Q9WTN6 564 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcrg-V7A0A0A6YYE8 116 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1366A0A1W2P740 328 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a34A2ADF7 318 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7951E9Q0A2 213 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd16E9Q173 522 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6482F6YHC1 213 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17124F6ZIG1 213 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aldh3b3J3QMK6 479 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxd9P28357 339 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klk1b26P36369 261 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh10P70408 788 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HbegfQ06186 208 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35g3Q5F297 340 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NnatQ61979 81 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smarcd3Q6P9Z1 483 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl13Q80TF4 654 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a29Q8BWG6 551 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uckl1Q91YL3 548 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.1 ms