Protein–RNA interactions for Protein: P20109

Il13, Interleukin-13, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il13P20109 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Il13P20109 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Il13P20109 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Il13P20109 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Il13P20109 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Il13P20109 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Il13P20109 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Il13P20109 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Il13P20109 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Il13P20109 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Il13P20109 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Il13P20109 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Il13P20109 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Il13P20109 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Il13P20109 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Il13P20109 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Il13P20109 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Il13P20109 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Il13P20109 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Il13P20109 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Il13P20109 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Il13P20109 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Il13P20109 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Il13P20109 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Il13P20109 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Il13P20109 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Il13P20109 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Il13P20109 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Il13P20109 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Il13P20109 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Il13P20109 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Il13P20109 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Il13P20109 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Il13P20109 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Il13P20109 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Il13P20109 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Il13P20109 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Il13P20109 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Il13P20109 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Il13P20109 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Il13P20109 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Il13P20109 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Il13P20109 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Il13P20109 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Il13P20109 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Il13P20109 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Il13P20109 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Il13P20109 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Il13P20109 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Il13P20109 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Il13P20109 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Il13P20109 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Il13P20109 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Il13P20109 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Il13P20109 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Il13P20109 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Il13P20109 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Il13P20109 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Il13P20109 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Il13P20109 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Il13P20109 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Il13P20109 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Il13P20109 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Il13P20109 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Il13P20109 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Il13P20109 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Il13P20109 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Il13P20109 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Il13P20109 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Il13P20109 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Il13P20109 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Il13P20109 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Il13P20109 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Il13P20109 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Il13P20109 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Il13P20109 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Il13P20109 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Il13P20109 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Il13P20109 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Il13P20109 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Il13P20109 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Il13P20109 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Il13P20109 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Il13P20109 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Il13P20109 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Il13P20109 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Il13P20109 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Il13P20109 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Il13P20109 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Il13P20109 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Il13P20109 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Il13P20109 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Il13P20109 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Il13P20109 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Il13P20109 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Il13P20109 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Il13P20109 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Il13P20109 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Il13P20109 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Il13P20109 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms