Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Ttc29Q80VM3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ttc29Q80VM3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ttc29Q80VM3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttc29Q80VM3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ttc29Q80VM3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Ttc29Q80VM3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ttc29Q80VM3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Ttc29Q80VM3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ttc29Q80VM3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ttc29Q80VM3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ttc29Q80VM3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ttc29Q80VM3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Ttc29Q80VM3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttc29Q80VM3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ttc29Q80VM3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttc29Q80VM3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ttc29Q80VM3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ttc29Q80VM3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc29Q80VM3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc29Q80VM3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ttc29Q80VM3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ttc29Q80VM3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ttc29Q80VM3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ttc29Q80VM3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ttc29Q80VM3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ttc29Q80VM3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ttc29Q80VM3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttc29Q80VM3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ttc29Q80VM3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc29Q80VM3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ttc29Q80VM3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc29Q80VM3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc29Q80VM3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttc29Q80VM3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc29Q80VM3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc29Q80VM3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc29Q80VM3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc29Q80VM3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttc29Q80VM3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc29Q80VM3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc29Q80VM3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ttc29Q80VM3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc29Q80VM3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc29Q80VM3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc29Q80VM3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttc29Q80VM3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc29Q80VM3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc29Q80VM3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc29Q80VM3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc29Q80VM3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc29Q80VM3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc29Q80VM3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc29Q80VM3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc29Q80VM3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc29Q80VM3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttc29Q80VM3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc29Q80VM3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc29Q80VM3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttc29Q80VM3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttc29Q80VM3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc29Q80VM3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ttc29Q80VM3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ttc29Q80VM3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ttc29Q80VM3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc29Q80VM3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttc29Q80VM3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ttc29Q80VM3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ttc29Q80VM3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttc29Q80VM3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttc29Q80VM3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttc29Q80VM3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ttc29Q80VM3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc29Q80VM3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc29Q80VM3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc29Q80VM3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc29Q80VM3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc29Q80VM3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc29Q80VM3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc29Q80VM3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc29Q80VM3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc29Q80VM3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttc29Q80VM3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc29Q80VM3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc29Q80VM3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttc29Q80VM3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc29Q80VM3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc29Q80VM3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc29Q80VM3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc29Q80VM3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc29Q80VM3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc29Q80VM3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc29Q80VM3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc29Q80VM3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc29Q80VM3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc29Q80VM3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc29Q80VM3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc29Q80VM3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc29Q80VM3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc29Q80VM3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
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