Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L3

Svil, Supervillin, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvilQ8K4L3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
SvilQ8K4L3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SvilQ8K4L3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SvilQ8K4L3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SvilQ8K4L3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SvilQ8K4L3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SvilQ8K4L3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SvilQ8K4L3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SvilQ8K4L3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SvilQ8K4L3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SvilQ8K4L3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SvilQ8K4L3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SvilQ8K4L3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SvilQ8K4L3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SvilQ8K4L3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SvilQ8K4L3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SvilQ8K4L3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SvilQ8K4L3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SvilQ8K4L3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SvilQ8K4L3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SvilQ8K4L3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SvilQ8K4L3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SvilQ8K4L3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SvilQ8K4L3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SvilQ8K4L3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SvilQ8K4L3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SvilQ8K4L3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SvilQ8K4L3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SvilQ8K4L3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SvilQ8K4L3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SvilQ8K4L3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SvilQ8K4L3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SvilQ8K4L3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SvilQ8K4L3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SvilQ8K4L3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SvilQ8K4L3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SvilQ8K4L3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SvilQ8K4L3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SvilQ8K4L3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SvilQ8K4L3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SvilQ8K4L3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SvilQ8K4L3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SvilQ8K4L3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SvilQ8K4L3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SvilQ8K4L3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SvilQ8K4L3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SvilQ8K4L3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SvilQ8K4L3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SvilQ8K4L3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SvilQ8K4L3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SvilQ8K4L3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SvilQ8K4L3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SvilQ8K4L3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SvilQ8K4L3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SvilQ8K4L3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SvilQ8K4L3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SvilQ8K4L3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SvilQ8K4L3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SvilQ8K4L3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
SvilQ8K4L3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SvilQ8K4L3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SvilQ8K4L3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SvilQ8K4L3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SvilQ8K4L3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SvilQ8K4L3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SvilQ8K4L3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SvilQ8K4L3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SvilQ8K4L3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SvilQ8K4L3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SvilQ8K4L3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SvilQ8K4L3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SvilQ8K4L3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SvilQ8K4L3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SvilQ8K4L3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SvilQ8K4L3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SvilQ8K4L3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SvilQ8K4L3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SvilQ8K4L3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SvilQ8K4L3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SvilQ8K4L3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SvilQ8K4L3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SvilQ8K4L3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SvilQ8K4L3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SvilQ8K4L3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SvilQ8K4L3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SvilQ8K4L3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SvilQ8K4L3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SvilQ8K4L3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SvilQ8K4L3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SvilQ8K4L3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SvilQ8K4L3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SvilQ8K4L3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SvilQ8K4L3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SvilQ8K4L3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SvilQ8K4L3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SvilQ8K4L3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SvilQ8K4L3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SvilQ8K4L3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SvilQ8K4L3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SvilQ8K4L3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms