RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	DAL7	P21826	554 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	PER1	P25625	357 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	GDH3	P39708	457 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	MAL11	P53048	616 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	TAD1	P53065	400 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	PEX19	Q07418	342 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	HAL9	Q12180	1030 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	ALG7	P07286	448 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	SPC29	P33419	253 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	KTR4	P38131	464 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	CTF8	P38877	133 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	ATP25	Q03153	612 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	REH1	Q06709	432 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	THI4	P32318	326 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	CTF13	P35203	478 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	PPS1	P38148	807 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	PUS2	P53167	370 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	RNH70	P53331	553 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	ALG12	P53730	551 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	YDR514C	Q04408	483 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	MET7	Q08645	548 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	GSY1	P23337	708 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	MEF1	P25039	761 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	PPG1	P32838	368 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	ASM4	Q05166	528 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	MDM12	Q92328	271 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YLR224W	YLR224W	MSH2	P25847	964 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	VHR1	P40522	640 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	FKH2	P41813	862 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	UBA2	P52488	636 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	UGO1	Q03327	502 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	PRC1	P00729	532 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	YHR078W	P38799	552 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	HXT16	P47185	567 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	GND2	P53319	492 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	RNT1	Q02555	471 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	YDR338C	Q05497	695 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	RSC3	Q06639	885 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	FRE5	Q08908	694 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	AIM44	Q99299	758 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	MTC2	P34246	357 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	MTH1	P35198	433 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	SAP190	P36123	1033 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	RPP1	P38786	293 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	DSS1	P39112	969 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	YML122C	Q03207	126 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	PEX6	P33760	1030 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	SAK1	P38990	1142 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	SHR5	P41912	237 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	ALY2	P47029	1046 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	MUP1	P50276	574 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	NTG2	Q08214	380 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	MCH5	Q08777	521 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	SWM1	Q12379	170 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	DIF1	O13577	133 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	CDC9	P04819	755 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	VBA3	P25594	458 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	YBR053C	P38235	358 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	PFA3	P42836	336 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	SSY5	P47002	699 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	CRR1	Q05790	422 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	THI21	Q08975	551 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	GPR1	Q12361	961 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	TRM11	Q12463	433 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	SRD1	P09007	221 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	MCD4	P36051	919 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	ELO3	P40319	345 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	CAF16	P43569	289 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	ASI2	P53895	289 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	ADY4	Q05955	493 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	IRC10	Q08118	586 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	ACF2	Q12168	779 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	SUT2	Q12286	268 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YLR224W	YLR224W	SPC42	P36094	363 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	MNN1	P39106	762 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	DLT1	Q04216	342 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	OMS1	Q06668	471 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	MIH1	P23748	554 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	YEL1	P34225	687 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.7 ms