RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	YLR125W	Q12138	136 aa		3.93	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	HAL9	Q12180	1030 aa		3.93	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	TRM11	Q12463	433 aa		3.93	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	DAL7	P21826	554 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	MOH1	P38191	138 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	DAM1	P53267	343 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	ATP25	Q03153	612 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	SWM1	Q12379	170 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	YCL002C	P25565	263 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	SUL1	P38359	859 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	NUP82	P40368	713 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	ALG2	P43636	503 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	HXT16	P47185	567 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	NIT3	P49954	291 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	TAD1	P53065	400 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	MRPS35	P53292	345 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	GPR1	Q12361	961 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AIM4	YBR194W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	ALG7	P07286	448 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	PHO8	P11491	566 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	GAL11	P19659	1081 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	MNN1	P39106	762 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	VHR1	P40522	640 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	MAL11	P53048	616 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	RNT1	Q02555	471 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	GIS1	Q03833	894 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	YOR022C	Q12204	715 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	SPC29	P33419	253 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	RPP1	P38786	293 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	OMS1	Q06668	471 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	REH1	Q06709	432 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	TSR4	P25040	408 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	TIM23	P32897	222 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	TOM20	P35180	183 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	YBR053C	P38235	358 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	SSY5	P47002	699 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	PUS2	P53167	370 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	TMN2	Q04562	672 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	ADY4	Q05955	493 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	MET7	Q08645	548 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	FRE5	Q08908	694 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	YLR415C	O13578	112 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	GDH3	P39708	457 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	PZF1	P39933	429 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	ELO3	P40319	345 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	FKH2	P41813	862 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	PFA3	P42836	336 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	STB4	P50104	949 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	DLT1	Q04216	342 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	YDR514C	Q04408	483 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	PRC1	P00729	532 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.86	□□□□□ -1.79	not detected
AIM4	YBR194W	MET3	P08536	511 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	THI4	P32318	326 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	PPS1	P38148	807 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	SAK1	P38990	1142 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	YJR142W	P47173	342 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	MUP1	P50276	574 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	MUK1	Q02866	612 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	ASM4	Q05166	528 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	ACF2	Q12168	779 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	ERR1	P0CX10	437 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	ERR2	P0CX11	437 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	GRX4	P32642	244 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	MTC2	P34246	357 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	SIC1	P38634	284 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	ZIP2	P53061	704 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	RTS3	P53289	263 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	PKH1	Q03407	766 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	YDR338C	Q05497	695 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	MSH2	P25847	964 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	AMA1	P50082	593 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	RSC3	Q06639	885 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	MCH5	Q08777	521 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
AIM4	YBR194W	NGG1	P32494	702 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	UBP12	P39538	1254 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	NRG1	Q03125	231 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	UGO1	Q03327	502 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	TGL5	Q12043	749 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	MDM12	Q92328	271 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	DIF1	O13577	133 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	PER1	P25625	357 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	MCD4	P36051	919 aa		3.82	□□□□□ -1.8

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