RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640888.1

LIAS-222, Transcript of lipoic acid synthetase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIAS, Length 4,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIAS-222	ENST00000640888	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	FOXO4	P98177	505 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	ITGA6	P23229	1130 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	AK2	P54819	239 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	HLF	Q16534	295 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	KRT32	Q14532	448 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	SIK1	P57059	783 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	APP	P05067	770 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	STK3	Q13188	491 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LIAS-222	ENST00000640888	STRC	Q7RTU9	1775 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	NLRP10	Q86W26	655 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	MRC1	P22897	1456 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	COL18A1	P39060	1754 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	HAUS7	Q99871	368 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	PKP1	Q13835	747 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	SLC27A2	O14975	620 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	PDE8A	O60658	829 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	CTSW	P56202	376 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	CASP7	P55210	303 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	GREM2	Q9H772	168 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	CIAO1	O76071	339 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	VPS53	Q5VIR6	699 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	NECAB1	Q8N987	351 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	VPS37D	Q86XT2	251 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888		H3BQV1	296 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	SLC5A1	P13866	664 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	ADORA1	P30542	326 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	IFFO2	Q5TF58	517 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	USP21	Q9UK80	565 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	BCL9	O00512	1426 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	TRDN	Q13061	729 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LIAS-222	ENST00000640888	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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