RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VAMP4	O75379	141 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NR1I2	O75469	434 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TUBB4A	P04350	444 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PDE1A	P54750	535 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TTC14	Q96N46	770 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SGSM2	O43147	1006 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPFIA4	O75335	1185 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LARGE1	O95461	756 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GJB2	P29033	226 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LIG3	P49916	1009 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AK2	P54819	239 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GSDMD	P57764	484 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HOMER1	Q86YM7	354 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TSPYL6	Q8N831	410 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ABCC1	P33527	1531 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EXOC5	O00471	708 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KCNJ6	P48051	423 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TICAM2	Q86XR7	235 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IL25	Q9H293	177 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PTPRT	O14522	1441 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CAVIN2	O95810	425 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PAX7	P23759	505 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CHML	P26374	656 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MCM6	Q14566	821 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VPS53	Q5VIR6	699 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CEP85	Q6P2H3	762 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CNNM3	Q8NE01	707 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC151	A5D8V7	595 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HSPA4	P34932	840 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRT85	P78386	507 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CLIC6	Q96NY7	704 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SSH2	Q76I76	1423 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NEBL	O76041	1014 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ELF1	P32519	619 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SCRN1	Q12765	414 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GBP6	Q6ZN66	633 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RABGGTA	Q92696	567 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-222	ENST00000637694		A0A087WWV3	80 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694		H0YHG0	523 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GPT	P24298	496 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ISM2	Q6H9L7	571 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FERMT3	Q86UX7	667 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MCM8	Q9UJA3	840 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UNC13B	O14795	1591 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C3	P01024	1663 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USP8	P40818	1118 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAP3K9	P80192	1104 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ST3GAL1	Q11201	340 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRT24	Q2M2I5	525 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BRD3	Q15059	726 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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