RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	MARK1	Q9P0L2	795 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	DBN1	Q16643	649 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	FAM182B	Q5T319	152 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	PNMA5	Q96PV4	448 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	THBS1	P07996	1170 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	TCF3	P15923	654 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	GSX2	Q9BZM3	304 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	BNIP3L	O60238	219 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	MAP3K6	O95382	1288 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	RECK	O95980	971 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	SOX18	P35713	384 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	RARA	P10276	462 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	EDN3	P14138	238 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	CES1	P23141	567 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	SPEM2	Q0P670	501 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538		Q6ZNB5	142 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	OR13H1	Q8NG92	308 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	AK5	Q9Y6K8	562 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	SASH3	O75995	380 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	PSAP	P07602	524 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	FGFR3	P22607	806 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	VEGFB	P49765	207 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	CRELD1	Q96HD1	420 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	PPFIA3	O75145	1194 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	PCSK7	Q16549	785 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	SV2A	Q7L0J3	742 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	SETDB2	Q96T68	719 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	EREG	O14944	169 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	MMP20	O60882	483 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	NFKB1	P19838	968 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	PLAUR	Q03405	335 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	BACH2	Q9BYV9	841 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	C12orf49	Q9H741	205 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	STRN4	Q9NRL3	753 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	CNTN3	Q9P232	1028 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	CD33	P20138	364 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	HYAL2	Q12891	473 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	FAM161B	Q96MY7	647 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	CDC14C	A4D256	554 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	KIF4A	O95239	1232 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	NRL	P54845	237 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	BHMT	Q93088	406 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	ZFAT	Q9P243	1243 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
EP300-208	ENST00000635538	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
EP300-208	ENST00000635538	SLC30A3	Q99726	388 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EP300-208	ENST00000635538	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
EP300-208	ENST00000635538	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
EP300-208	ENST00000635538	GSTT1	P30711	240 aa		7.32	□□□□□ -1.24

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