RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		19.83	■□□□□ 0.77
EP300-208	ENST00000635538	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
EP300-208	ENST00000635538	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	17.39	■□□□□ 0.37
EP300-208	ENST00000635538	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	16.88	■□□□□ 0.29
EP300-208	ENST00000635538	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		16.34	■□□□□ 0.21
EP300-208	ENST00000635538	FOXD1	Q16676	465 aa		15.51	■□□□□ 0.07
EP300-208	ENST00000635538	ADRA2B	P18089	450 aa		15.2	■□□□□ 0.02
EP300-208	ENST00000635538	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EP300-208	ENST00000635538	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
EP300-208	ENST00000635538	POTED	Q86YR6	584 aa		14.62	□□□□□ -0.07
EP300-208	ENST00000635538	KCNA4	P22459	653 aa		14.46	□□□□□ -0.09
EP300-208	ENST00000635538	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		14.38	□□□□□ -0.11
EP300-208	ENST00000635538	MSH5	O43196	834 aa		14.28	□□□□□ -0.12
EP300-208	ENST00000635538	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	14.23	□□□□□ -0.13
EP300-208	ENST00000635538	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	14.1	□□□□□ -0.15
EP300-208	ENST00000635538	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.95	□□□□□ -0.18
EP300-208	ENST00000635538	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
EP300-208	ENST00000635538	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
EP300-208	ENST00000635538	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EP300-208	ENST00000635538	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
EP300-208	ENST00000635538	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EP300-208	ENST00000635538	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EP300-208	ENST00000635538	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EP300-208	ENST00000635538	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EP300-208	ENST00000635538	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
EP300-208	ENST00000635538	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.29	□□□□□ -0.28
EP300-208	ENST00000635538	ZBTB22	O15209	634 aa		13.28	□□□□□ -0.28
EP300-208	ENST00000635538	SLC4A2	P04920	1241 aa		13	□□□□□ -0.33
EP300-208	ENST00000635538	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
EP300-208	ENST00000635538	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		12.85	□□□□□ -0.35
EP300-208	ENST00000635538	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		12.85	□□□□□ -0.35
EP300-208	ENST00000635538	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	12.76	□□□□□ -0.37	2e-7	■□□□□ 8
EP300-208	ENST00000635538	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
EP300-208	ENST00000635538	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
EP300-208	ENST00000635538	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
EP300-208	ENST00000635538		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
EP300-208	ENST00000635538	APLP2	Q06481	763 aa		12.5	□□□□□ -0.41
EP300-208	ENST00000635538	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
EP300-208	ENST00000635538	FKBP8	Q14318	412 aa		12.26	□□□□□ -0.45
EP300-208	ENST00000635538	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
EP300-208	ENST00000635538	RNF39	Q9H2S5	420 aa		12.21	□□□□□ -0.45
EP300-208	ENST00000635538	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
EP300-208	ENST00000635538	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
EP300-208	ENST00000635538	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
EP300-208	ENST00000635538	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
EP300-208	ENST00000635538	CAPN15	O75808	1086 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EP300-208	ENST00000635538	FBLN2	P98095	1184 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EP300-208	ENST00000635538	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
EP300-208	ENST00000635538	POLA2	Q14181	598 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EP300-208	ENST00000635538	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
EP300-208	ENST00000635538	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		11.9	□□□□□ -0.5
EP300-208	ENST00000635538	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
EP300-208	ENST00000635538	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.85	□□□□□ -0.51
EP300-208	ENST00000635538	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
EP300-208	ENST00000635538	PROM2	Q8N271	834 aa		11.79	□□□□□ -0.52
EP300-208	ENST00000635538	ABCB7	O75027	752 aa		11.78	□□□□□ -0.52
EP300-208	ENST00000635538	DSG3	P32926	999 aa		11.73	□□□□□ -0.53
EP300-208	ENST00000635538	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EP300-208	ENST00000635538	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EP300-208	ENST00000635538	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EP300-208	ENST00000635538	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
EP300-208	ENST00000635538	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
EP300-208	ENST00000635538	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		11.53	□□□□□ -0.56
EP300-208	ENST00000635538	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		11.51	□□□□□ -0.57
EP300-208	ENST00000635538	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		11.47	□□□□□ -0.57
EP300-208	ENST00000635538	SLC24A1	O60721	1099 aa		11.43	□□□□□ -0.58
EP300-208	ENST00000635538	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
EP300-208	ENST00000635538	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	11.39	□□□□□ -0.59
EP300-208	ENST00000635538	POTEH	Q6S545	545 aa		11.32	□□□□□ -0.6
EP300-208	ENST00000635538	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EP300-208	ENST00000635538	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EP300-208	ENST00000635538	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
EP300-208	ENST00000635538	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EP300-208	ENST00000635538	PLEKHG5	O94827	1062 aa		11.27	□□□□□ -0.61
EP300-208	ENST00000635538	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
EP300-208	ENST00000635538	MIER1	Q8N108	512 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EP300-208	ENST00000635538	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EP300-208	ENST00000635538	PKD2	Q13563	968 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EP300-208	ENST00000635538	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
EP300-208	ENST00000635538	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-208	ENST00000635538	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
EP300-208	ENST00000635538	TRIM41	Q8WV44	630 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EP300-208	ENST00000635538	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.02	□□□□□ -0.65
EP300-208	ENST00000635538	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
EP300-208	ENST00000635538	PRR29	P0C7W0	189 aa		11	□□□□□ -0.65
EP300-208	ENST00000635538	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		10.99	□□□□□ -0.65
EP300-208	ENST00000635538	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
EP300-208	ENST00000635538	GSE1	Q14687	1217 aa		10.97	□□□□□ -0.65
EP300-208	ENST00000635538	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
EP300-208	ENST00000635538	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
EP300-208	ENST00000635538	RGL2	O15211	777 aa		10.91	□□□□□ -0.66
EP300-208	ENST00000635538	CREBZF	Q9NS37	354 aa		10.91	□□□□□ -0.66
EP300-208	ENST00000635538	NUBP1	P53384	320 aa		10.89	□□□□□ -0.67
EP300-208	ENST00000635538	PITPNM1	O00562	1244 aa		10.87	□□□□□ -0.67
EP300-208	ENST00000635538	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.87	□□□□□ -0.67
EP300-208	ENST00000635538	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EP300-208	ENST00000635538	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	10.85	□□□□□ -0.67
EP300-208	ENST00000635538	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
EP300-208	ENST00000635538	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
EP300-208	ENST00000635538	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		10.83	□□□□□ -0.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.5 ms