RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 BICD2Q8TD16 824 aa20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 EPC1Q9H2F5 836 aa20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 RAI14Q9P0K7 980 aa20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 TADA3O75528 432 aa20.55■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.55■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 GSDMDP57764 484 aa20.55■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.55■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 BECN2A8MW95 431 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 CPP00450 1065 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 HOMER1Q86YM7 354 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 PIK3C2BO00750 1634 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 ST3GAL1Q11201 340 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 DNAI1Q9UI46 699 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 GNAI3P08754 354 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 ADGRB1O14514 1584 aa20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 FAM83GA6ND36 823 aa20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 NECAB1Q8N987 351 aa20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 ADGRB3O60242 1522 aa20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 CARD6Q9BX69 1037 aa20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.52■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 TPM1P09493 284 aa20.52■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 HOMEZQ8IX15 550 aa20.52■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.52■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 EVCP57679 992 aa20.52■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 STAP2Q9UGK3 403 aa20.52■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 SGSM2O43147 1006 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 RPS6KA5O75582 802 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 H3BQF6 201 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 DCTN1Q14203 1278 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 PGBD1Q96JS3 809 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 STX1AQ16623 288 aa20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 ME3Q16798 604 aa20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 TUBB4AP04350 444 aa20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 FBLN1P23142 703 aa20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 NBPF11Q86T75 865 aa20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 A0A087WWV3 80 aa20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 FUT8Q9BYC5 575 aa20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 VPS53Q5VIR6 699 aa20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 RPAINQ86UA6 219 aa20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 IDI1Q13907 227 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 SPG7Q9UQ90 795 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 TRDNQ13061 729 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 PPP2R5AQ15172 486 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.46■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 SMC2O95347 1197 aa20.46■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 GNAI2P04899 355 aa20.46■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 PRAM1Q96QH2 718 aa20.46■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 VPS18Q9P253 973 aa20.46■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 FANCGO15287 622 aa20.46■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.46■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 ZFYVE9O95405 1425 aa20.46■□□□□ 0.87
GLIS1-202ENST00000628545 PDCP20941 246 aa20.45■□□□□ 0.86
GLIS1-202ENST00000628545 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms