RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 ZBTB3Q9H5J0 574 aa17.55■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 TNIP1Q15025 636 aa17.54■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 USP48Q86UV5 1035 aa17.54■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 NLRP3Q96P20 1036 aa17.54■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 BCL2L13Q9BXK5 485 aa17.54■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 YDJCA8MPS7 323 aa17.53■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 MYL6BP14649 208 aa17.53■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 SLC10A5Q5PT55 438 aa17.53■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 RGMBQ6NW40 437 aa17.53■□□□□ 0.4
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CTIF-211ENST00000592658 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
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CTIF-211ENST00000592658 RNF186Q9NXI6 227 aa17.51■□□□□ 0.39
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CTIF-211ENST00000592658 DPF2Q92785 391 aa17.5■□□□□ 0.39
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CTIF-211ENST00000592658 TRPA1O75762 1119 aa17.49■□□□□ 0.39
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CTIF-211ENST00000592658 LRP10Q7Z4F1 713 aa17.49■□□□□ 0.39
CTIF-211ENST00000592658 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
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CTIF-211ENST00000592658 KRT26Q7Z3Y9 468 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-211ENST00000592658 C2orf69Q8N8R5 385 aa17.48■□□□□ 0.39
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CTIF-211ENST00000592658 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
CTIF-211ENST00000592658 CSRNP1Q96S65 589 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-211ENST00000592658 AKAP11Q9UKA4 1901 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-211ENST00000592658 ADM5C9JUS6 153 aa17.46■□□□□ 0.39
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CTIF-211ENST00000592658 SLC10A3P09131 477 aa17.46■□□□□ 0.39
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CTIF-211ENST00000592658 HTTP42858 3142 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-211ENST00000592658 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
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CTIF-211ENST00000592658 PDIA6Q15084 440 aa17.45■□□□□ 0.38
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CTIF-211ENST00000592658 RPS12P25398 132 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-211ENST00000592658 PROSER3Q2NL68 480 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-211ENST00000592658 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
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CTIF-211ENST00000592658 CENPFP49454 3210 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-211ENST00000592658 ANXA1P04083 346 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-211ENST00000592658 TMC4Q7Z404 712 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-211ENST00000592658 NLRP10Q86W26 655 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-211ENST00000592658 DBNDD1Q9H9R9 158 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-211ENST00000592658 RTL9Q8NET4 1388 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-211ENST00000592658 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-211ENST00000592658 WASHC4Q2M389 1173 aa17.41■□□□□ 0.38
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CTIF-211ENST00000592658 KCNQ5Q9NR82 932 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-211ENST00000592658 TSPYL4Q9UJ04 414 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-211ENST00000592658 BRCA2P51587 3418 aa17.41■□□□□ 0.38
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CTIF-211ENST00000592658 POLLQ9UGP5 575 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 COL4A1P02462 1669 aa17.39■□□□□ 0.37
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CTIF-211ENST00000592658 ECE2O60344 883 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 SULF1Q8IWU6 871 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 CDCA5Q96FF9 252 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 SH3TC1Q8TE82 1336 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 TCIRG1Q13488 830 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 COPS6Q7L5N1 327 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 SCN9AQ15858 1988 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa17.36■□□□□ 0.37
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