RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583763.1

CSAG4-202, Transcript of CSAG family member 4 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene CSAG4, Length 237 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG4-202ENST00000583763 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 RGL2O15211 777 aa13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 KCNQ3O43525 872 aa13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 C3orf67Q6ZVT6 689 aa13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 TTC5Q8N0Z6 440 aa13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 ARMC5Q96C12 935 aa13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 NBPF26B4DH59 902 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 H7C1D1 291 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 CAP1Q01518 475 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 MOB2Q70IA6 237 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 OTOP1Q7RTM1 612 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 IL17REQ8NFR9 667 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 DPF2Q92785 391 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 CDCA5Q96FF9 252 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 TNIP1Q15025 636 aa13.27□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa13.27□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF652Q9Y2D9 606 aa13.26□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 PTPN22Q9Y2R2 807 aa13.26□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 TRIM17Q9Y577 477 aa13.26□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 PSMD14O00487 310 aa13.24□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 FMNL2Q96PY5 1086 aa13.24□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 DUOX1Q9NRD9 1551 aa13.24□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 UBE2Q2LH0YL09 131 aa13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 FKBP1BP68106 108 aa13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 LRCH3Q96II8 777 aa13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 KCNQ5Q9NR82 932 aa13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 SUPT20HQ8NEM7 779 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF333Q96JL9 665 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 GGA3Q9NZ52 723 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 UBN2Q6ZU65 1347 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 HMOX1P09601 288 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 CDCA8Q53HL2 280 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 SUSD4Q5VX71 490 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 SULF1Q8IWU6 871 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG4-202ENST00000583763 RTL9Q8NET4 1388 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 SP8Q8IXZ3 490 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 NUP98P52948 1817 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 ABCC4O15439 1325 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 MPNDQ8N594 471 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 NYXQ9GZU5 481 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 MUC3AQ02505 3323 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 NTSR2O95665 410 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF609O15014 1411 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 RPS12P25398 132 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 SCN9AQ15858 1988 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 TEFQ10587 303 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 SCARF1Q14162 830 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 SLC10A5Q5PT55 438 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 CD99L2Q8TCZ2 262 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 DBNDD1Q9H9R9 158 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 EYSQ5T1H1 3165 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 TAF1P21675 1872 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 ERVV-1B6SEH8 477 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 BBOX1O75936 387 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 SREBF2Q12772 1141 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF34Q8IZ26 560 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-202ENST00000583763 ERBB4Q15303 1308 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 BTBD11A6QL63 1104 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 GPTP24298 496 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 SPRYD7Q5W111 196 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 IFNL1Q8IU54 200 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 SHISA4Q96DD7 197 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 LRRC37AA6NMS7 1700 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 LAMB1P07942 1786 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 LAMB2P55268 1798 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 GNAT3A8MTJ3 354 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 ALDH1A1P00352 501 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 VIL1P09327 827 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 TTLL7Q6ZT98 887 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 EFCC1Q9HA90 598 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 A0A1W2PPC1 479 aa13.12□□□□□ -0.31
CSAG4-202ENST00000583763 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms