RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 IGFLR1Q9H665 355 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 CARNS1A5YM72 827 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 SASH3O75995 380 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 SCNN1AP37088 669 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 TRIM11Q96F44 468 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 NAGPAQ9UK23 515 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 PCSK7Q16549 785 aa7.34□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.34□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.34□□□□□ -1.23
GDE1-202ENST00000563645 ZBTB39O15060 712 aa7.33□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 GPLD1P80108 840 aa7.33□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.33□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 TRPM4Q8TD43 1214 aa7.33□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 NRLP54845 237 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 GPR152Q8TDT2 470 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 PLVAPQ9BX97 442 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 MTMR7Q9Y216 660 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 LILRB5O75023 590 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 NID1P14543 1247 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 FAM35AQ86V20 835 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 NLRP13Q86W25 1043 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 KRBA1A5PL33 1030 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 ZBTB42B2RXF5 422 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 MMP20O60882 483 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 PSAPP07602 524 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 CPB1P15086 417 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 MPSTP25325 297 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 SOX18P35713 384 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 PLAURQ03405 335 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 RETREG2Q8NC44 543 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 NUDT8Q8WV74 236 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 IGHA1P01876 353 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 ITGB2P05107 769 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 MTMR3Q13615 1198 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 ATCAYQ86WG3 371 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 PERM1Q5SV97 790 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GDE1-202ENST00000563645 NPR3P17342 541 aa7.27□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.27□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.27□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 EDEM1Q92611 657 aa7.27□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 ABL1P00519 1130 aa7.26□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 PDGFAP04085 211 aa7.26□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 PCSK2P16519 638 aa7.26□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 PDE4CQ08493 712 aa7.26□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.26□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 OR13H1Q8NG92 308 aa7.26□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 TTC9Q92623 222 aa7.26□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.25□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 FAM229AH3BQW9 127 aa7.25□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 MSTNO14793 375 aa7.25□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 FAM13AO94988 1023 aa7.25□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 SIK1P57059 783 aa7.25□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 GRIK5Q16478 980 aa7.25□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.25□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.25□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 J3QW42 95 aa7.24□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 GHRHP01286 108 aa7.24□□□□□ -1.25
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