RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560350.5

USP3-AS1-206, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 407 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-206ENST00000560350 NBPF4Q96M43 638 aa10.25□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.25□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 MON2Q7Z3U7 1717 aa10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 NRAPQ86VF7 1730 aa10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 CTHP32929 405 aa10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 TUSC1Q2TAM9 212 aa10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 MPNDQ8N594 471 aa10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 KIFC2Q96AC6 838 aa10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 CAMKK2Q96RR4 588 aa10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 MAP10Q9P2G4 905 aa10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 DISP2A7MBM2 1401 aa10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 WFS1O76024 890 aa10.23□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 QPCTQ16769 361 aa10.23□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 NBPF14Q5TI25 921 aa10.23□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.23□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 USP54Q70EL1 1684 aa10.22□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 LILRB3O75022 631 aa10.21□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.21□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 SPG7Q9UQ90 795 aa10.21□□□□□ -0.77
USP3-AS1-206ENST00000560350 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa10.21□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa10.21□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 COL18A1P39060 1754 aa10.21□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 BMP1P13497 986 aa10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 TNS2Q63HR2 1409 aa10.19□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.19□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 LCE2CQ5TA81 110 aa10.19□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 FOXJ1Q92949 421 aa10.19□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa10.18□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa10.18□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 MTHFSP49914 203 aa10.18□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 NNTQ13423 1086 aa10.18□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 TERTO14746 1132 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 IFNL2Q8IZJ0 200 aa10.17□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 USHBP1Q8N6Y0 703 aa10.17□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.17□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 KCNQ2O43526 872 aa10.16□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 IL13P35225 146 aa10.16□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 CLK2P49760 499 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 TXNRD1Q16881 649 aa10.16□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.16□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 SLC27A3Q5K4L6 730 aa10.16□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 ACSBG1Q96GR2 724 aa10.16□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 CFAP53Q96M91 514 aa10.16□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 CDK15Q96Q40 435 aa10.16□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGSF1Q8N6C5 1336 aa10.15□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 ADH1CP00326 375 aa10.15□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 TSC1Q92574 1164 aa10.15□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
USP3-AS1-206ENST00000560350 WIPF1O43516 503 aa10.14□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 TIMP2P16035 220 aa10.14□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 NUDCQ9Y266 331 aa10.14□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 NCAPD2Q15021 1401 aa10.14□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 CYP27B1O15528 508 aa10.13□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 SULT6B1Q6IMI4 303 aa10.13□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.13□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 STK32BQ9NY57 414 aa10.13□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.12□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 PHKG2P15735 406 aa10.12□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 PTF1AQ7RTS3 328 aa10.12□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 DCAF5Q96JK2 942 aa10.12□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 SLC15A2Q16348 729 aa10.11□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 C1orf141Q5JVX7 400 aa10.11□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZFP42Q96MM3 310 aa10.11□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 POLR3EQ9NVU0 708 aa10.11□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 MYOM1P52179 1685 aa10.11□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 MEGF6O75095 1541 aa10.11□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 BRWD3Q6RI45 1802 aa10.1□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 RALBP1Q15311 655 aa10.1□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa10.1□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.1□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 ARMC2Q8NEN0 867 aa10.1□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa10.1□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.1□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 KDRP35968 1356 aa10.1□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 NR3C2P08235 984 aa10.09□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 PPP2R1AP30153 589 aa10.09□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 GRM5P41594 1212 aa10.09□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 AGERQ15109 404 aa10.09□□□□□ -0.79
USP3-AS1-206ENST00000560350 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms