RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	ABCC4	O15439	1325 aa		8.99	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		8.99	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	COL4A5	P29400	1685 aa		8.98	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	AOC2	O75106	756 aa		8.98	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	PDIA6	Q15084	440 aa		8.98	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		8.98	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		8.98	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	8.98	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	8.98	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		8.98	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	CACNA1S	Q13698	1873 aa		8.98	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	RAD17	O75943	681 aa		8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	TCIRG1	Q13488	830 aa		8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	GRAP	Q13588	217 aa		8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	NLRP10	Q86W26	655 aa		8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	LTBP1	Q14766	1721 aa		8.97	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	8.96	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	COPS6	Q7L5N1	327 aa		8.96	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	CCDC102A	Q96A19	550 aa		8.96	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		8.96	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		8.96	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	TSKS	Q9UJT2	592 aa		8.96	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		8.95	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	8.95	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	HUNK	P57058	714 aa		8.95	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	RIPK4	P57078	832 aa		8.95	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	DGKZ	Q13574	1117 aa		8.95	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	WASHC4	Q2M389	1173 aa		8.95	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	USP48	Q86UV5	1035 aa		8.95	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	MICALL2	Q8IY33	904 aa		8.95	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		8.95	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	8.95	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	YDJC	A8MPS7	323 aa		8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	PROSER3	Q2NL68	480 aa		8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	RGMB	Q6NW40	437 aa		8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	SLC51A	Q86UW1	340 aa		8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	CFAP44	Q96MT7	982 aa		8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	EYA3	Q99504	573 aa		8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	NUP98	P52948	1817 aa		8.94	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	PSMD14	O00487	310 aa		8.93	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	HOXB7	P09629	217 aa		8.93	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	8.93	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		8.93	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		8.93	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		8.93	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		8.92	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	8.92	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	C6orf229	H3BNL8	230 aa		8.92	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	ANXA1	P04083	346 aa		8.92	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	8.92	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	8.92	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		8.92	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	SULF1	Q8IWU6	871 aa		8.92	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	NECTIN2	Q92692	538 aa		8.92	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	8.92	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	8.92	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	8.92	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	CHL1	O00533	1208 aa		8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	ECE2	O60344	883 aa		8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	FKBP1B	P68106	108 aa		8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	RALBP1	Q15311	655 aa		8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	CCDC184	Q52MB2	194 aa		8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	ZIC5	Q96T25	663 aa		8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	HYPK	Q9NX55	129 aa		8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	RNF186	Q9NXI6	227 aa		8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	POLL	Q9UGP5	575 aa		8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		8.91	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	PCNT	O95613	3336 aa		8.9	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	SHTN1	A0MZ66	631 aa		8.9	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688		G3V3G9	751 aa		8.9	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	RIMBP2	O15034	1052 aa		8.9	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	ANP32C	O43423	234 aa		8.9	□□□□□ -0.98
CS-233	ENST00000552688	GPSM2	P81274	684 aa		8.9	□□□□□ -0.98

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