RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 CEP63Q96MT8 703 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 SLAIN2Q9P270 581 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 SFI1A8K8P3 1242 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 APBA3O96018 575 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 ALBP02768 609 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 ADH7P40394 386 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 OGFOD1Q8N543 542 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.97□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 NID1P14543 1247 aa6.97□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 TYRO3Q06418 890 aa6.97□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.97□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 SIX5Q8N196 739 aa6.97□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.97□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 SUSD3Q96L08 255 aa6.97□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.96□□□□□ -1.29
HDAC2-216ENST00000523628 PTPRGP23470 1445 aa6.96□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 FAM229AH3BQW9 127 aa6.96□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 ATG7O95352 703 aa6.96□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.96□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.96□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 NACC1Q96RE7 527 aa6.96□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 TEX14Q8IWB6 1497 aa6.96□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.96□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 ABCC2Q92887 1545 aa6.96□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 C21orf2O43822 256 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 STK32AQ8WU08 396 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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HDAC2-216ENST00000523628 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 PTK7Q13308 1070 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 BHMTQ93088 406 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 DIP2BQ9P265 1576 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 LILRB5O75023 590 aa6.93□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.93□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 GRIK4Q16099 956 aa6.93□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 HIF1AQ16665 826 aa6.93□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.93□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.93□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 EFCC1Q9HA90 598 aa6.93□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.93□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 UACAQ9BZF9 1416 aa6.93□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.92□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA0556O60303 1618 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 C9orf172C9J069 976 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 USP17L15C9J2P7 530 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 USP17L10C9JJH3 530 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 USP17L12C9JPN9 530 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 USP17L11C9JVI0 530 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 USP17L21D6R901 530 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 USP17L18D6R9N7 530 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 USP17L22D6RA61 530 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 USP17L19D6RCP7 530 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 USP17L20D6RJB6 530 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 DYRK3O43781 588 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 RASA1P20936 1047 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 SEC13P55735 322 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 USP17L24Q0WX57 530 aa6.91□□□□□ -1.3
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HDAC2-216ENST00000523628 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.91□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 KDM6BO15054 1643 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 FAM196BA6NMK8 535 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 IER5Q5VY09 327 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 NGLY1Q96IV0 654 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.9□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0A0MRY4 1105 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRE1Q14246 886 aa6.89□□□□□ -1.31
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