RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516411.1

RNU6-977P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 977, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-977P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-977P-201ENST00000516411 USP17L24Q0WX57 530 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 HIF1AQ16665 826 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 EFHC2Q5JST6 749 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 IER5Q5VY09 327 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC9A9Q8IVB4 645 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 TNS4Q8IZW8 715 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 PGBD3Q8N328 593 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 TPCN2Q8NHX9 752 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 L3MBTL2Q969R5 705 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 COL26A1Q96A83 441 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 MYO19Q96H55 970 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZIC5Q96T25 663 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 EFCC1Q9HA90 598 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM53CQ9NYF3 392 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 SERTAD1Q9UHV2 236 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 SERPINA10Q9UK55 444 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 USP3Q9Y6I4 520 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-977P-201ENST00000516411 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ATAD2Q6PL18 1390 aa1.84□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 A0A1W2PNR3 127 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 BNIP3LO60238 219 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ARAFP10398 606 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 BMP4P12644 408 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 HOXA5P20719 270 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 GRIK1P39086 918 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 PHKA2P46019 1235 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 PLA2G4AP47712 749 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 TNP2Q05952 138 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM69CQ0P6D2 419 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 DPYDQ12882 1025 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRR23CQ6ZRP0 262 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 CBLL1Q75N03 491 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC51AQ86UW1 340 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM200AQ8TCP9 573 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 PBXIP1Q96AQ6 731 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 MDFIQ99750 246 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 CABP1Q9NZU7 370 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 CHMP3Q9Y3E7 222 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 SFI1A8K8P3 1242 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 NEURL1BA8MQ27 555 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 C2CD2LO14523 706 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ADRB1P08588 477 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 MAPTP10636 758 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 SYN1P17600 705 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 FGFR3P22607 806 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 TXLNAP40222 546 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 OCLNQ16625 522 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 RTN1Q16799 776 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 DTX1Q86Y01 620 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 RUBCNLQ9H714 662 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 HCN2Q9UL51 889 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 TGFBR3LH3BV60 316 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 SIN3BO75182 1162 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 RFX1P22670 979 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 CTBSQ01459 385 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 RHPN1Q8TCX5 695 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 TNFRSF25Q93038 417 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 AIDAQ96BJ3 306 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 ABHD17AQ96GS6 310 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 SUSD3Q96L08 255 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 PHACTR1Q9C0D0 580 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 C1orf115Q9H7X2 142 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 GPAMQ9HCL2 828 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRDM6Q9NQX0 595 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 MARK1Q9P0L2 795 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 TMEM88BA6NKF7 163 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 EGFRP00533 1210 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-977P-201ENST00000516411 SELPP16109 830 aa1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125 ms