RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	APBB1	O00213	710 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFV2	P19404	249 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	MX1	P20591	662 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	MCC	P23508	829 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	FUT2	Q10981	343 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC14	Q96N46	770 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR14	Q9BWN1	585 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	6.01	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPRU	Q92729	1446 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	SPTLC1	O15269	473 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	HOXA2	O43364	376 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXO3	O43524	673 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	UQCRH	P07919	91 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	GNAI3	P08754	354 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	HSPA4	P34932	840 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP6V1A	P38606	617 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	APLP1	P51693	650 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPN5	P54829	565 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	USP48	Q86UV5	1035 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	SSH3	Q8TE77	659 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNB2	Q92953	911 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	IL25	Q9H293	177 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	NWD1	Q149M9	1564 aa		6	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	RAD50	Q92878	1312 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	ITSN1	Q15811	1721 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	SBNO1	A3KN83	1393 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	SGSM2	O43147	1006 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	GJA5	P36382	358 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	FLII	Q13045	1269 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF214	Q8ND24	703 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	ACE	P12821	1306 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	FLT4	P35916	1363 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB11FIP3	O75154	756 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	FDX1	P10109	184 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	RUFY3	Q7L099	469 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	HLA-C	Q95604	372 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	USP44	Q9H0E7	712 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP3K5	Q99683	1374 aa		5.97	□□□□□ -1.45

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