RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514515.5

NREP-222, Transcript of neuronal regeneration related protein, human

TSL 1 (best)

Gene NREP, Length 3,564 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NREP-222	ENST00000514515		Q6ZUG5	572 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	FSIP1	Q8NA03	581 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	NEK1	Q96PY6	1258 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	ARHGEF10	O15013	1369 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	MAP3K5	Q99683	1374 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	BIN1	O00499	593 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	ANO10	Q9NW15	660 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	NEMF	O60524	1076 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	CAVIN2	O95810	425 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	ISM2	Q6H9L7	571 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	GTF3C6	Q969F1	213 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NREP-222	ENST00000514515	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	TMC6	Q7Z403	805 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	ERO1A	Q96HE7	468 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	ST7	Q9NRC1	585 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	SBNO1	A3KN83	1393 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	TPM4	P67936	248 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	KRT32	Q14532	448 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	SYCP1	Q15431	976 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	TERF2	Q15554	542 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	MNS1	Q8NEH6	495 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	VGLL3	A8MV65	326 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	CTAGE5	O15320	804 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	HOXC9	P31274	260 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	NEO1	Q92859	1461 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515		A0A1B0GVL5	298 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	SLFN14	P0C7P3	912 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	MYL6B	P14649	208 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	CHST3	Q7LGC8	479 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	STK38	Q15208	465 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	PROSER3	Q2NL68	480 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	UBXN4	Q92575	508 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	SUCLG2	Q96I99	432 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	USP28	Q96RU2	1077 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	GRM8	O00222	908 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	SASH1	O94885	1247 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	CHGB	P05060	677 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	APOBR	Q0VD83	1088 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	IQCB1	Q15051	598 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	TIGD1	Q96MW7	591 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	IFNK	Q9P0W0	207 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	DNAI1	Q9UI46	699 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	GSDMD	P57764	484 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	REST	Q13127	1097 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	KSR2	Q6VAB6	950 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	KLHL34	Q8N239	644 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	ZBTB9	Q96C00	473 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NREP-222	ENST00000514515	TMX1	Q9H3N1	280 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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