RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 CCDC69A6NI79 296 aa6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 MCM5P33992 734 aa6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 RCAN1P53805 252 aa6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 AIDAQ96BJ3 306 aa6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 EYA2O00167 538 aa6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 NEMFO60524 1076 aa6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 NEK4P51957 841 aa6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 PDE4BQ07343 736 aa6.87□□□□□ -1.31
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POLK-215ENST00000514141 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.87□□□□□ -1.31
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POLK-215ENST00000514141 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 WDR19Q8NEZ3 1342 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 CACNA1FO60840 1977 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 APPP05067 770 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 TMEM87BQ96K49 555 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 ATP5JP18859 108 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 TCIRG1Q13488 830 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 OLFM4Q6UX06 510 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 NCOA7Q8NI08 942 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 SEMA3FQ13275 785 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 STIM1Q13586 685 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 SETDB2Q96T68 719 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 SMTNL1A8MU46 457 aa6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 ATP2B3Q16720 1220 aa6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 USP25Q9UHP3 1055 aa6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 CCDC171Q6TFL3 1326 aa6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 BECN2A8MW95 431 aa6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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POLK-215ENST00000514141 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 USP54Q70EL1 1684 aa6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 KINO60870 393 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 COPS6Q7L5N1 327 aa6.85□□□□□ -1.31
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POLK-215ENST00000514141 NBR1Q14596 966 aa6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.85□□□□□ -1.31
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POLK-215ENST00000514141 NBPF4Q96M43 638 aa6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 TOMM22Q9NS69 142 aa6.85□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.85□□□□□ -1.31
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POLK-215ENST00000514141 B4DLN1 442 aa6.84□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 HLA-DOAP06340 250 aa6.84□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 CALML3P27482 149 aa6.84□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 RFC4P35249 363 aa6.84□□□□□ -1.31
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POLK-215ENST00000514141 BRAPQ7Z569 592 aa6.84□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 LPIN2Q92539 896 aa6.84□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 SH2D4AQ9H788 454 aa6.84□□□□□ -1.31
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POLK-215ENST00000514141 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.84□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 BRINP3Q76B58 766 aa6.84□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.84□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 NAPBQ9H115 298 aa6.84□□□□□ -1.31
POLK-215ENST00000514141 MARCH6O60337 910 aa6.84□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 MYL6BP14649 208 aa6.84□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.84□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 BICD2Q8TD16 824 aa6.84□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.83□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.83□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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