RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, human

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP25-208	ENST00000478932	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	PTH1R	Q03431	593 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	EVX2	Q03828	476 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	RASEF	Q8IZ41	740 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	EVI5L	Q96CN4	794 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	USP21	Q9UK80	565 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	PHLPP1	O60346	1717 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	EYA2	O00167	538 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	FSD1	Q9BTV5	496 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	GREM2	Q9H772	168 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		5	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932		A0A0D9SFI3	127 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	ST18	O60284	1047 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	DTNB	O60941	627 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	PRR29	P0C7W0	189 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	CPA1	P15085	419 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	PKP1	Q13835	747 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	ITGB4	P16144	1822 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932		A0A1B0GUL7	405 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	ATP5J	P18859	108 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	ITGA6	P23229	1130 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	HSPA1L	P34931	641 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	HSPA4	P34932	840 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	DDIT3	P35638	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	VPS72	Q15906	364 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	SNRK	Q9NRH2	765 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	SLIT2	O94813	1529 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	SNAP23	O00161	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	GOLIM4	O00461	696 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	CSF1R	P07333	972 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	MCC	P23508	829 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	RAD50	Q92878	1312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	COL15A1	P39059	1388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	JCAD	Q9P266	1359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	ADORA1	P30542	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	KCNJ4	P48050	445 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	CERK	Q8TCT0	537 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	MCM4	P33991	863 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	CTSW	P56202	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	ANAPC15	P60006	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	SCARF1	Q14162	830 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP25-208	ENST00000478932	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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