RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	NBPF26	B4DH59	902 aa		10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	RGS20	O76081	388 aa		10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	A1BG	P04217	495 aa		10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	SMIM5	Q71RC9	77 aa		10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	WDR63	Q8IWG1	891 aa		10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	NBPF15	Q8N660	670 aa		10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	MBIP	Q9NS73	344 aa		10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		10.87	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	ATP10D	Q9P241	1426 aa		10.86	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	CAMTA2	O94983	1202 aa		10.86	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	TM4SF1	P30408	202 aa		10.86	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		10.86	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		10.86	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	DDX12P	Q92771	950 aa		10.86	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	WBP1L	Q9NX94	342 aa		10.86	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		10.86	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	NUP98	P52948	1817 aa		10.86	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	CACNA1F	O60840	1977 aa		10.85	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		10.85	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		10.85	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		10.85	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	ZNF521	Q96K83	1311 aa		10.84	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	TGFB2	P61812	414 aa		10.84	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	DDR1	Q08345	913 aa		10.84	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	EPAS1	Q99814	870 aa		10.84	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		10.84	□□□□□ -0.67
USP34-208	ENST00000467128	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		10.83	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	NFIX	Q14938	502 aa		10.83	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	PDIA6	Q15084	440 aa		10.83	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	10.83	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		10.83	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		10.83	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	HYPK	Q9NX55	129 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	CHD4	Q14839	1912 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	SERPINB2	P05120	415 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	KRT24	Q2M2I5	525 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	SETDB2	Q96T68	719 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	MYL6B	P14649	208 aa		10.79	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		10.79	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		10.79	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	CNBD1	Q8NA66	436 aa		10.79	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		10.79	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	TSKS	Q9UJT2	592 aa		10.79	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	LAMB2	P55268	1798 aa		10.78	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128		E9PSI1	815 aa		10.78	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	PROSER3	Q2NL68	480 aa		10.78	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	PARP10	Q53GL7	1025 aa		10.78	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		10.78	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		10.78	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		10.78	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	NYX	Q9GZU5	481 aa		10.78	□□□□□ -0.68
USP34-208	ENST00000467128	GRIN3B	O60391	1043 aa		10.77	□□□□□ -0.69
USP34-208	ENST00000467128	PDE6B	P35913	854 aa		10.77	□□□□□ -0.69
USP34-208	ENST00000467128	ST5	P78524	1137 aa		10.77	□□□□□ -0.69
USP34-208	ENST00000467128	NBR1	Q14596	966 aa		10.77	□□□□□ -0.69
USP34-208	ENST00000467128	COPS6	Q7L5N1	327 aa		10.77	□□□□□ -0.69
USP34-208	ENST00000467128	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		10.77	□□□□□ -0.69
USP34-208	ENST00000467128	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		10.77	□□□□□ -0.69
USP34-208	ENST00000467128	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		10.77	□□□□□ -0.69
USP34-208	ENST00000467128	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.69
USP34-208	ENST00000467128	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
USP34-208	ENST00000467128	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.76	□□□□□ -0.69
USP34-208	ENST00000467128	HLF	Q16534	295 aa		10.76	□□□□□ -0.69
USP34-208	ENST00000467128	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		10.76	□□□□□ -0.69
USP34-208	ENST00000467128	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69

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