RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461134.1

TTPAL-205, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 2

Gene TTPAL, Length 3,455 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-205ENST00000461134 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 GTF3C6Q969F1 213 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 MMP10P09238 476 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 CASQ1P31415 396 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 USP31Q70CQ4 1352 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 MAP3K5Q99683 1374 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 SYT10Q6XYQ8 523 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 KRBA2Q6ZNG9 492 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 KIF16BQ96L93 1317 aa9.55□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 CAMKK2Q96RR4 588 aa9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 MYD88Q99836 296 aa9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 IFT172Q9UG01 1749 aa9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 DDIT3P35638 169 aa9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 E2F4Q16254 413 aa9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 DRC7Q8IY82 874 aa9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 G3V3G9 751 aa9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 NOP2P46087 812 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 PDE3AQ14432 1141 aa9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 GPT2Q8TD30 523 aa9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.54□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 G2E3Q7L622 706 aa9.53□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.53□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 CPDO75976 1380 aa9.53□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.53□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 SYNE4Q8N205 404 aa9.53□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.53□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 FAM212AQ96EL1 285 aa9.53□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 TNNQ9UQP3 1299 aa9.53□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.53□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 NWD1Q149M9 1564 aa9.53□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 MYO1CO00159 1063 aa9.52□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 MBD3O95983 291 aa9.52□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 CHRNA5P30532 468 aa9.52□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 GPS2Q13227 327 aa9.52□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.52□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.52□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 FAM89AQ96GI7 184 aa9.52□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.52□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 USP32Q8NFA0 1604 aa9.52□□□□□ -0.88
TTPAL-205ENST00000461134 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 GUCY2CP25092 1073 aa9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 SLFN5Q08AF3 891 aa9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 NEXNQ0ZGT2 675 aa9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 SATB1Q01826 763 aa9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 SETDB2Q96T68 719 aa9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 SIL1Q9H173 461 aa9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.52□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 SYT17Q9BSW7 474 aa9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 CTIFO43310 598 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 AK9Q5TCS8 1911 aa9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 CYP2C19P33261 490 aa9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 PKP1Q13835 747 aa9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.51□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 A0A1B0GUL7 405 aa9.5□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 SMTNL1A8MU46 457 aa9.5□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 CFAP44Q96MT7 982 aa9.5□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.5□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.5□□□□□ -0.89
TTPAL-205ENST00000461134 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms