RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058		A0A087WZG4	1122 aa		20.23	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	TAF5L	O75529	589 aa		20.23	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	20.23	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	NECAB1	Q8N987	351 aa		20.23	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		20.22	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	20.22	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	RPS6KB1	P23443	525 aa		20.22	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	ANKRD1	Q15327	319 aa		20.22	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		20.22	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	20.22	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	20.22	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	20.22	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		20.22	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	20.21	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	KLHL34	Q8N239	644 aa		20.21	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	TJP1	Q07157	1748 aa		20.21	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		20.21	■□□□□ 0.83
TOM1-210	ENST00000449058	FIBP	O43427	364 aa		20.2	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		20.2	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	PAPPA	Q13219	1627 aa		20.2	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	NBPF26	B4DH59	902 aa		20.2	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	20.2	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	20.2	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	NBPF14	Q5TI25	921 aa		20.2	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	20.2	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	NBPF15	Q8N660	670 aa		20.2	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	HAUS7	Q99871	368 aa		20.2	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF609	O15014	1411 aa		20.19	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058		H7C1W4	665 aa		20.19	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	DTNB	O60941	627 aa		20.19	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		20.19	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		20.19	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	FOXO4	P98177	505 aa		20.19	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	UVSSA	Q2YD98	709 aa		20.19	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	20.18	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	20.18	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	OFD1	O75665	1012 aa		20.18	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	MCM5	P33992	734 aa		20.18	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		20.18	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		20.18	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	KRT32	Q14532	448 aa		20.17	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		20.17	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	PDC	P20941	246 aa		20.17	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	20.17	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		20.17	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		20.17	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		20.17	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		20.16	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		20.16	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		20.15	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	20.15	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		20.15	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		20.15	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		20.15	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	20.15	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	20.15	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		20.14	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		20.14	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		20.14	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	GPR108	Q9NPR9	543 aa		20.14	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	20.14	■□□□□ 0.82
TOM1-210	ENST00000449058	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		20.14	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		20.14	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		20.14	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	PALLD	Q8WX93	1383 aa		20.14	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	20.13	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	20.13	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	NEK1	Q96PY6	1258 aa		20.13	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	LAMA4	Q16363	1823 aa		20.13	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	CHGB	P05060	677 aa		20.13	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	TICAM2	Q86XR7	235 aa		20.13	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	20.13	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	ELP1	O95163	1332 aa		20.13	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	20.12	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	KRT85	P78386	507 aa		20.12	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		20.12	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	20.12	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	BRINP3	Q76B58	766 aa		20.12	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	TTC6	Q86TZ1	520 aa		20.12	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	TNS2	Q63HR2	1409 aa		20.11	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	CYP21A2	P08686	494 aa		20.11	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	SPEF2	Q9C093	1822 aa		20.11	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	A1BG	P04217	495 aa		20.1	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	20.1	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		20.1	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	GTF3C6	Q969F1	213 aa		20.1	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	20.1	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		20.1	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		20.1	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		20.1	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		20.1	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	TPM2	P07951	284 aa		20.09	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		20.09	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	FERMT3	Q86UX7	667 aa		20.09	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	ABCA3	Q99758	1704 aa		20.09	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	STK3	Q13188	491 aa		20.09	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		20.09	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		20.09	■□□□□ 0.81
TOM1-210	ENST00000449058	ATG3	Q9NT62	314 aa		20.08	■□□□□ 0.81

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