RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429751.6

RRN3-203, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,198 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-203ENST00000429751 SLC15A2Q16348 729 aa9.78□□□□□ -0.84
RRN3-203ENST00000429751 IL17RAQ96F46 866 aa9.78□□□□□ -0.84
RRN3-203ENST00000429751 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
RRN3-203ENST00000429751 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.78□□□□□ -0.84
RRN3-203ENST00000429751 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.78□□□□□ -0.84
RRN3-203ENST00000429751 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 KRT24Q2M2I5 525 aa9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 BCORQ6W2J9 1755 aa9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 COL15A1P39059 1388 aa9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 GNPATO15228 680 aa9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 C4AP0C0L4 1744 aa9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 PALD1Q9ULE6 856 aa9.77□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 USP48Q86UV5 1035 aa9.76□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.76□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa9.76□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 SCN7AQ01118 1682 aa9.76□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 ERVV-1B6SEH8 477 aa9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 A1BGP04217 495 aa9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 CHMLP26374 656 aa9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 CCT4P50991 539 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 KIF6Q6ZMV9 814 aa9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 PDIA6Q15084 440 aa9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 ZNF652Q9Y2D9 606 aa9.75□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 CASZ1Q86V15 1759 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 NBPF26B4DH59 902 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 SLC4A2P04920 1241 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 MX1P20591 662 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 RFC4P35249 363 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 ZNF827Q17R98 1081 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 KLHL34Q8N239 644 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 NBPF15Q8N660 670 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 NARFQ9UHQ1 456 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 NUP98P52948 1817 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 ZPR1O75312 459 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 ADCY5O95622 1261 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 GNAI2P04899 355 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 KCNQ4P56696 695 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 USP25Q9UHP3 1055 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 LRP10Q7Z4F1 713 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 ARID3AQ99856 593 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 STAP2Q9UGK3 403 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 RILPL2Q969X0 211 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 AOX1Q06278 1338 aa9.72□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa9.72□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 EP400Q96L91 3159 aa9.72□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 MYL6BP14649 208 aa9.72□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 DMTNQ08495 405 aa9.72□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 FLIIQ13045 1269 aa9.72□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.72□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.72□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.72□□□□□ -0.85
RRN3-203ENST00000429751 KDM4AO75164 1064 aa9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms