RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406859.7

NRXN1-211, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NRXN1, Length 2,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-211ENST00000406859 BECN2A8MW95 431 aa8.49□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 TULP2O00295 520 aa8.49□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 CCP110O43303 1012 aa8.49□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 TPM4P67936 248 aa8.49□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 KIF12Q96FN5 646 aa8.49□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.49□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.49□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.49□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.49□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 TPM1P09493 284 aa8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 CYP2C19P33261 490 aa8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 STX1AQ16623 288 aa8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 IL25Q9H293 177 aa8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 ATP8B1O43520 1251 aa8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 LARGE1O95461 756 aa8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 ELF2Q15723 593 aa8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 ME3Q16798 604 aa8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 KCNJ6P48051 423 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 GPS2Q13227 327 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 ERICH4A6NGS2 130 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 CCDC69A6NI79 296 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 FAM117AQ9C073 453 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 USP44Q9H0E7 712 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 ANO10Q9NW15 660 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 SPG7Q9UQ90 795 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.47□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 IQCB1Q15051 598 aa8.46□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 NECTIN1Q15223 517 aa8.46□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa8.46□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.46□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 EVI5LQ96CN4 794 aa8.46□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.46□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 C3P01024 1663 aa8.46□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 AKAP12Q02952 1782 aa8.46□□□□□ -1.05
NRXN1-211ENST00000406859 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 NR1I2O75469 434 aa8.46□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa8.46□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.46□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 FERMT3Q86UX7 667 aa8.46□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 GPR37O15354 613 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 CPA1P15085 419 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 CCZ1BP86790 482 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 ATL3Q6DD88 541 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 ERC1Q8IUD2 1116 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 CEP57L1Q8IYX8 460 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 NECAB1Q8N987 351 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 SRGAP3O43295 1099 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 UBXN4Q92575 508 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 ECHDC1Q9NTX5 307 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 MIS18AQ9NYP9 233 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 HMG20BQ9P0W2 317 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 RGPD1P0DJD0 1748 aa8.45□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 USP27XA6NNY8 438 aa8.44□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 H3BQV1 296 aa8.44□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 PTH1RQ03431 593 aa8.44□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 KRT32Q14532 448 aa8.44□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 IFFO2Q5TF58 517 aa8.44□□□□□ -1.06
NRXN1-211ENST00000406859 MAP4K1Q92918 833 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.8 ms