RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361201.8

CSAG4-201, Transcript of CSAG family member 4 (pseudogene), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CSAG4, Length 755 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG4-201ENST00000361201 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 RGL2O15211 777 aa13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 KCNQ3O43525 872 aa13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 C3orf67Q6ZVT6 689 aa13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 TTC5Q8N0Z6 440 aa13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 ARMC5Q96C12 935 aa13.29□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 NBPF26B4DH59 902 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 H7C1D1 291 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 CAP1Q01518 475 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 MOB2Q70IA6 237 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 OTOP1Q7RTM1 612 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 IL17REQ8NFR9 667 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 DPF2Q92785 391 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 CDCA5Q96FF9 252 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 TNIP1Q15025 636 aa13.27□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa13.27□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF652Q9Y2D9 606 aa13.26□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 PTPN22Q9Y2R2 807 aa13.26□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 TRIM17Q9Y577 477 aa13.26□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 PSMD14O00487 310 aa13.24□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 FMNL2Q96PY5 1086 aa13.24□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 DUOX1Q9NRD9 1551 aa13.24□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 UBE2Q2LH0YL09 131 aa13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 FKBP1BP68106 108 aa13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 LRCH3Q96II8 777 aa13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 KCNQ5Q9NR82 932 aa13.23□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 SUPT20HQ8NEM7 779 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF333Q96JL9 665 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 GGA3Q9NZ52 723 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 UBN2Q6ZU65 1347 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 HMOX1P09601 288 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 CDCA8Q53HL2 280 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 SUSD4Q5VX71 490 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 SULF1Q8IWU6 871 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG4-201ENST00000361201 RTL9Q8NET4 1388 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 SP8Q8IXZ3 490 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 NUP98P52948 1817 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 ABCC4O15439 1325 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 POTEDQ86YR6 584 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 MPNDQ8N594 471 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 NYXQ9GZU5 481 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 MUC3AQ02505 3323 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 NTSR2O95665 410 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF609O15014 1411 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 RPS12P25398 132 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 SCN9AQ15858 1988 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 TEFQ10587 303 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 SCARF1Q14162 830 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 SLC10A5Q5PT55 438 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 CD99L2Q8TCZ2 262 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 DBNDD1Q9H9R9 158 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 EYSQ5T1H1 3165 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 TAF1P21675 1872 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 ERVV-1B6SEH8 477 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 BBOX1O75936 387 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 SREBF2Q12772 1141 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF34Q8IZ26 560 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG4-201ENST00000361201 ERBB4Q15303 1308 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 BTBD11A6QL63 1104 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 GPTP24298 496 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 SPRYD7Q5W111 196 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 IFNL1Q8IU54 200 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 SHISA4Q96DD7 197 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 LRRC37AA6NMS7 1700 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 LAMB1P07942 1786 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 LAMB2P55268 1798 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 GNAT3A8MTJ3 354 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 ALDH1A1P00352 501 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 VIL1P09327 827 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 TTLL7Q6ZT98 887 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG4-201ENST00000361201 EFCC1Q9HA90 598 aa13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.5 ms