RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359128.9

NLRC3-202, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NLRC3, Length 6,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-202ENST00000359128 ATP2B3Q16720 1220 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 CTAGE5O15320 804 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 USP37Q86T82 979 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 NEK1Q96PY6 1258 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 MBIPQ9NS73 344 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 FAM83GA6ND36 823 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 SLC39A6Q13433 755 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 ESR2Q92731 530 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 MCM5P33992 734 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 TBC1D5Q92609 795 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 MYZAPP0CAP1 466 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 FSIP1Q8NA03 581 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 CALM1P0DP23 149 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 CALM2P0DP24 149 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 CALM3P0DP25 149 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 PLCG2P16885 1265 aa14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 KANK3Q6NY19 840 aa14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 COPS6Q7L5N1 327 aa14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 ANXA1P04083 346 aa14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 WDR97A6NE52 1622 aa14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 ASXL2Q76L83 1435 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 GJB2P29033 226 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 TAF12Q16514 161 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 GNAQP50148 359 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 SYCE3A1L190 88 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC66A2RUB6 948 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 GNPATO15228 680 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC172P0C7W6 258 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 TMTC2Q8N394 836 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 KRT13P13646 458 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 HSPA2P54652 639 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 NAPAP54920 295 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 RMND1Q9NWS8 449 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 GBP3Q9H0R5 595 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 C6orf50Q9HD87 102 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 PAFAH1B1P43034 410 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 BACH2Q9BYV9 841 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 MCM3P25205 808 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 INCENPQ9NQS7 918 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 ACTN2P35609 894 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 RTN1Q16799 776 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 PICK1Q9NRD5 415 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 MAP9Q49MG5 647 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 BTG4Q9NY30 223 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 ZBTB43O43298 467 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 STAT6P42226 847 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 FAM212AQ96EL1 285 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 PANK2Q9BZ23 570 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 KIF4AO95239 1232 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 FERP16591 822 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 GNAT2P19087 354 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 TCHPQ9BT92 498 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 TRIM27P14373 513 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms