RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 KIF3AQ9Y496 699 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 KRT85P78386 507 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 SPATA32Q96LK8 384 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 ATF3P18847 181 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 VPS53Q5VIR6 699 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 BRF1Q92994 677 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 GCKRQ14397 625 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF592Q92610 1267 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 STRN4Q9NRL3 753 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 LIG1P18858 919 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 A0A087WWV3 80 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 DACT1Q9NYF0 836 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 TCHHQ07283 1943 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 TERF1P54274 439 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 LUZP1Q86V48 1076 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 MYRIPQ8NFW9 859 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 HOXB7P09629 217 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 TTC6Q86TZ1 520 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 TNMDQ9H2S6 317 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SPNS2-201ENST00000329078 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 HAND2P61296 217 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 NECTIN1Q15223 517 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 Q6ZUG5 572 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 ZBTB22O15209 634 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 WASHC4Q2M389 1173 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 PXDNQ92626 1479 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 NPHP1O15259 732 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 MCM5P33992 734 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 HIP1O00291 1037 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 A1BGP04217 495 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC192P0DO97 292 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 TRIM5Q9C035 493 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 REREQ9P2R6 1566 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 MAP4K1Q92918 833 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 NEK1Q96PY6 1258 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 ST3GAL1Q11201 340 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 PIK3C2AO00443 1686 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 TNNI3KQ59H18 835 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 MAP3K11Q16584 847 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 APOBRQ0VD83 1088 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 PDIA6Q15084 440 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS2-201ENST00000329078 RPS6KB1P23443 525 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 A0A0G2JLW4 131 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 PDCP20941 246 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 ANO6Q4KMQ2 910 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 ERBB3P21860 1342 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 PHKG2P15735 406 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 TAF5LO75529 589 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 MTX1Q13505 466 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD1Q15327 319 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS2-201ENST00000329078 CYP27B1O15528 508 aa23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms