RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 GJB2P29033 226 aa13.64□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.64□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 CEP63Q96MT8 703 aa13.64□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 STK32BQ9NY57 414 aa13.64□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 STX6O43752 255 aa13.63□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 UBA7P41226 1012 aa13.63□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 PDE3AQ14432 1141 aa13.63□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 APBA3O96018 575 aa13.63□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 CETN1Q12798 172 aa13.63□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 WTAPQ15007 396 aa13.63□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 IQCEQ6IPM2 695 aa13.63□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.63□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 EEF2P13639 858 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 MCM9Q9NXL9 1143 aa13.63□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 GPCPD1Q9NPB8 672 aa13.63□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 EXOC1Q9NV70 894 aa13.63□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 URI1O94763 535 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 TRAPPC3LQ5T215 181 aa13.62□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa13.62□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 SH3BP5O60239 455 aa13.62□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 STAMBPO95630 424 aa13.62□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 ADGRL1O94910 1474 aa13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 PICK1Q9NRD5 415 aa13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 PTGS1P23219 599 aa13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 CNGA1P29973 690 aa13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 BCS1LQ9Y276 419 aa13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 TNNI2P48788 182 aa13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAJC5BQ9UF47 199 aa13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 ERLIN1O75477 346 aa13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 SPECC1Q5M775 1068 aa13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa13.61□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 TMC6Q7Z403 805 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 ANO3Q9BYT9 981 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 UQCRHLA0A096LP55 91 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 UQCRHP07919 91 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 TSNARE1Q96NA8 513 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM47Q96LD4 638 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP2C2O75185 946 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 STAT6P42226 847 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 BIRC2Q13490 618 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 TICAM2Q86XR7 235 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 NCOA7Q8NI08 942 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 KIF5CO60282 957 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 LMBR1LQ6UX01 489 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 FCHSD1Q86WN1 690 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 GPIHBP1Q8IV16 184 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC50Q8IVM0 306 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 UFL1O94874 794 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 SPDYE3A6NKU9 549 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 TMCO3Q6UWJ1 677 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 TRERF1Q96PN7 1200 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM107BQ9H098 131 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 JADE2Q9NQC1 790 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 MBIPQ9NS73 344 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 AMPD3Q01432 767 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 RRAGBQ5VZM2 374 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 TPTE2Q6XPS3 522 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 CRACR2AQ9BSW2 395 aa13.59□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 PTPDC1A2A3K4 754 aa13.58□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 MCM7P33993 719 aa13.58□□□□□ -0.23
UBASH3B-201ENST00000284273 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 GSTA5Q7RTV2 222 aa13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC63Q8NA47 563 aa13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 CLIP2Q9UDT6 1046 aa13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 TTC21AQ8NDW8 1320 aa13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF34Q969K3 372 aa13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 EVI5LQ96CN4 794 aa13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 GRPEL1Q9HAV7 217 aa13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 PPP2R5CQ13362 524 aa13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 TMOD4Q9NZQ9 345 aa13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
UBASH3B-201ENST00000284273 RASA3Q14644 834 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103 ms