RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.82■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 JAK2O60674 1132 aa21.82■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 IGKV5-2P06315 115 aa21.82■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 MTX1Q13505 466 aa21.82■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.82■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 RPS6KB1P23443 525 aa21.81■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 KRT32Q14532 448 aa21.81■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 Q6ZUG5 572 aa21.81■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 TTC6Q86TZ1 520 aa21.81■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 WASHC4Q2M389 1173 aa21.81■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.81■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 LUZP1Q86V48 1076 aa21.81■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.81■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 TCHHQ07283 1943 aa21.81■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 LIG1P18858 919 aa21.8■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 BECN2A8MW95 431 aa21.8■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 CHGBP05060 677 aa21.8■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.8■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.79■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.79■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 CHST3Q7LGC8 479 aa21.79■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 DYNC1I1O14576 645 aa21.78■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 TIMM10P62072 90 aa21.78■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 TNNI3KQ59H18 835 aa21.78■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.78■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.78■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.78■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 TYRO3Q06418 890 aa21.77■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 ZNF592Q92610 1267 aa21.77■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 SNRKQ9NRH2 765 aa21.77■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 KIF3AQ9Y496 699 aa21.77■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 KAZALD1Q96I82 304 aa21.77■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.77■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.76■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.76■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.76■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.76■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 ME1P48163 572 aa21.75■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.75■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.75■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.75■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 TAF5LO75529 589 aa21.75■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 ZNF165P49910 485 aa21.74■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.74■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.74■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 CFAP45Q9UL16 551 aa21.74■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 AP5Z1O43299 807 aa21.73■■□□□ 1.07
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LRP3-201ENST00000253193 HAND2P61296 217 aa21.73■■□□□ 1.07
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LRP3-201ENST00000253193 PTGS1P23219 599 aa21.73■■□□□ 1.07
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LRP3-201ENST00000253193 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.73■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.73■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 MAP7D2Q96T17 732 aa21.72■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 CPLX1O14810 134 aa21.72■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 PHKG2P15735 406 aa21.72■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.72■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 KINO60870 393 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 APPP05067 770 aa21.71■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 ERBB3P21860 1342 aa21.71■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 ATP5JP18859 108 aa21.71■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.71■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
LRP3-201ENST00000253193 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 STRN4Q9NRL3 753 aa21.7■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.7■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 TPM3P06753 285 aa21.7■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 PDIA6Q15084 440 aa21.7■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 NR1I2O75469 434 aa21.7■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 ST3GAL1Q11201 340 aa21.7■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.7■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.69■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 CYP21A2P08686 494 aa21.69■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 CBX1P83916 185 aa21.69■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.69■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.69■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.69■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.68■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 DCAF5Q96JK2 942 aa21.68■■□□□ 1.06
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