RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gripap1	Q8VD04	806 aa		33.21	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ttc19	Q8CC21	365 aa		33.21	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mrpl50	Q8VDT9	159 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hdac6	Q9Z2V5	1149 aa		33.21	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zyx	Q62523	564 aa		33.2	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Clcn1	Q64347	994 aa		33.2	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Eef2k	O08796	724 aa		33.19	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rdm1	Q9CQK3	281 aa		33.19	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Krt25	Q8VCW2	446 aa		33.19	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Aox1	O54754	1333 aa		33.18	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kdm3a	Q6PCM1	1323 aa		33.18	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Timm10	P62073	90 aa		33.18	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Npc1l1	Q6T3U4	1333 aa		33.18	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kank4	Q6P9J5	1016 aa		33.17	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Asap2	Q7SIG6	958 aa		33.17	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mb21d2	Q8C525	428 aa		33.17	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nol10	Q5RJG1	687 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Syce3	B5KM66	88 aa		33.16	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ppil4	Q9CXG3	492 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pde4d	Q01063	747 aa		33.16	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Golim4	Q8BXA1	655 aa		33.16	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Trim44	Q9QXA7	346 aa		33.16	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Met	P16056	1379 aa		33.15	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Plcb3	P51432	1234 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nol12	Q8BG17	217 aa		33.15	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sik1	Q60670	779 aa		33.14	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Clca2	Q8BG22	942 aa		33.14	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gimap5	Q8BWF2	308 aa		33.14	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ginm1	Q91WR6	327 aa		33.14	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nasp	Q99MD9	773 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kndc1	Q0KK55	1742 aa		33.14	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kat6b	Q8BRB7	1872 aa		33.14	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dcaf5	Q80T85	946 aa		33.14	■■■□□ 2.9
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lrrfip2	Q91WK0	415 aa		33.13	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Usp44	Q8C2S0	711 aa		33.13	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ddx54	Q8K4L0	874 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Npepps	Q11011	920 aa		33.12	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lrrc59	Q922Q8	307 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nip7	Q9CXK8	180 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Greb1l	B9EJV3	1913 aa		33.12	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fancc	P50652	591 aa		33.11	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Jmjd4	Q8BFT6	427 aa		33.11	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tceanc2	Q8R2M0	207 aa		33.11	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccdc129	Q14B48	1034 aa		33.11	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Usp48	Q3V0C5	1052 aa		33.1	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bloc1s2	Q9CWG9	143 aa		33.1	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp19a1	P28649	503 aa		33.09	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ppp6r1	Q7TSI3	856 aa		33.09	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Irgm2	A0A140LIF8	407 aa		33.09	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ube2h	P62257	183 aa		33.09	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cep57l1	Q8VDS7	400 aa		33.09	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slc4a1	P04919	929 aa		33.08	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ppp4r3b	Q922R5	820 aa		33.08	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ybx3	Q9JKB3	361 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dpyd	Q8CHR6	1025 aa		33.08	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nlrp3	Q8R4B8	1033 aa		33.08	■■■□□ 2.89
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Atp8a2	P98200	1148 aa		33.07	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ppp1r10	Q80W00	888 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ssc5d	Q8BV57	1371 aa		33.07	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zfp113	Q8C689	439 aa		33.06	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ncoa5	Q91W39	579 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccdc178	Q8CDV0	866 aa		33.06	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Med4	Q9CQA5	270 aa		33.06	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Exoc5	Q3TPX4	708 aa		33.05	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Adam1a	Q60813	791 aa		33.05	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp2d10	P24456	504 aa		33.05	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ftl2	P49945	183 aa		33.05	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ptcd1	Q8C2E4	695 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tsr2	Q8C8T8	191 aa		33.05	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gpt	Q8QZR5	496 aa		33.05	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fkbp1a	P26883	108 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Stat1	P42225	749 aa		33.04	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pus3	Q9JI38	481 aa		33.04	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Igbp1b	Q9QZ29	343 aa		33.04	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tnks	Q6PFX9	1320 aa		33.03	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Leo1	Q5XJE5	667 aa		33.03	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kdm4a	Q8BW72	1064 aa		33.03	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ankrd31	A0A140LI88	1765 aa		33.03	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Igflr1	Q3U4N7	345 aa		33.03	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Atp8b3	Q6UQ17	1335 aa		33.02	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mast2	Q60592	1734 aa		33.02	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tsks	O54887	585 aa		33.02	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Prkcsh	O08795	521 aa		33.01	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Prl7a2	O54831	253 aa		33.01	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Znf692	Q3U381	531 aa		33.01	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rassf8	Q8CJ96	419 aa		33.01	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mad1l1	Q9WTX8	717 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.88
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bcan	Q61361	883 aa		33.01	■■■□□ 2.87
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Casc1	Q6TDU8	730 aa		33.01	■■■□□ 2.87
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sh3bp5	Q9Z131	463 aa		33.01	■■■□□ 2.87
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp3a57	D3YYZ0	503 aa		33	■■■□□ 2.87
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hspd1	P63038	573 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccdc158	Q8CDI6	1109 aa		33	■■■□□ 2.87
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Srrt	Q99MR6	875 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myh1	Q5SX40	1942 aa		33	■■■□□ 2.87
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Aida	Q8C4Q6	305 aa		33	■■■□□ 2.87
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zbtb1	Q91VL9	713 aa		33	■■■□□ 2.87
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccdc66	Q6NS45	935 aa		32.99	■■■□□ 2.87
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pde3a	Q9Z0X4	1141 aa		32.99	■■■□□ 2.87
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myh7	Q91Z83	1935 aa		32.99	■■■□□ 2.87

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