RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000094245.3

Cldn3-201, Transcript of Claudin-3, mousemouse

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Gene Cldn3, Length 1,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Tight Junction .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tnip1Q9WUU8 647 aa23.68■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa23.67■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Map3k15A2AQW0 1331 aa23.67■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Trim34bJ3QNR8 485 aa23.67■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ralbp1Q62172 648 aa23.67■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Best3Q6H1V1 669 aa23.67■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 HlfQ8BW74 295 aa23.67■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Naa16Q9DBB4 864 aa23.67■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Zbtb38Q3LR78 1197 aa23.66■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ksr2Q3UVC0 959 aa23.66■■□□□ 1.38
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Cldn3-201ENSMUST00000094245 WasP70315 520 aa23.65■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Llgl2Q3TJ91 1027 aa23.65■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 NrdcQ8BHG1 1161 aa23.65■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Trim26Q99PN3 545 aa23.65■■□□□ 1.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Vamp4O70480 141 aa23.64■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Znf219Q6IQX8 726 aa23.64■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ecm29Q6PDI5 1840 aa23.63■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 GmpsQ3THK7 693 aa23.63■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Angel2Q8K1C0 544 aa23.63■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Chl1P70232 1209 aa23.62■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 CpvlQ9D3S9 478 aa23.62■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gas2l2Q5SSG4 860 aa23.61■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa23.61■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ripor2Q80U16 1078 aa23.6■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 NinQ61043 2035 aa23.6■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Celf1P28659 486 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ptrh1Q8BW00 204 aa23.59■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa23.59■■□□□ 1.37
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Heg1E9Q7X6 1337 aa23.58■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa23.57■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Slc39a11Q8BWY7 342 aa23.57■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa23.57■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Psmd14O35593 310 aa23.56■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Itga6Q61739 1091 aa23.56■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Igf2bp3Q9CPN8 579 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Slfn1Q9Z0I7 337 aa23.56■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 EvplQ9D952 2035 aa23.55■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Bend4P86174 541 aa23.55■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Map3k13Q1HKZ5 959 aa23.55■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ccdc30Q8BVF4 654 aa23.55■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 HellsQ60848 821 aa23.54■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 1700029H14RikE9PY36 240 aa23.53■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Zap70P43404 618 aa23.53■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 NyxP83503 476 aa23.53■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ell2Q3UKU1 639 aa23.53■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tmem67Q8BR76 992 aa23.53■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ccdc60Q8C4J0 545 aa23.53■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fzd9Q9R216 592 aa23.53■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 IntuQ059U7 942 aa23.52■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Aifm3Q3TY86 605 aa23.52■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Polr3glQ8R0C0 218 aa23.52■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Kcnq5Q9JK45 933 aa23.52■■□□□ 1.36
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ube4aE9Q735 1028 aa23.51■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rps12P63323 132 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cnot7Q60809 285 aa23.51■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Anks4bQ8K3X6 423 aa23.51■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Slc14a2Q8R4T9 930 aa23.51■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 AaasP58742 546 aa23.5■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 CbarpQ66L44 698 aa23.5■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Bend3Q6PAL0 825 aa23.5■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Il15P48346 162 aa23.49■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ascc2Q91WR3 749 aa23.49■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Phrf1A6H619 1682 aa23.48■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Nectin2P32507 530 aa23.48■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gm2163Q6PCY5 473 aa23.47■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 NexnQ7TPW1 607 aa23.47■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tmco5bQ80X59 307 aa23.47■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Sytl4Q9R0Q1 673 aa23.47■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fstl1Q62356 306 aa23.46■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa23.46■■□□□ 1.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cxcl9P18340 126 aa23.45■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Smc4Q8CG47 1286 aa23.45■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Grm8P47743 908 aa23.44■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Terf1P70371 421 aa23.44■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Celf2Q9Z0H4 508 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Psme4Q5SSW2 1843 aa23.43■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 D1Pas1P16381 660 aa23.43■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gnat3Q3V3I2 354 aa23.43■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Znf496Q5SXI5 585 aa23.43■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa23.43■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tm4sf4Q91XD3 202 aa23.43■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 LeprP48356 1162 aa23.42■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Slc38a10Q5I012 1090 aa23.42■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 RubcnQ80U62 956 aa23.42■■□□□ 1.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Pou3f3P31361 497 aa23.41■■□□□ 1.34
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