RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000094245.3

Cldn3-201, Transcript of Claudin-3, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Cldn3, Length 1,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Tight Junction .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa43.4■■■■■ 4.54
Cldn3-201ENSMUST00000094245 NischQ80TM9 1593 aa42.64■■■■■ 4.42
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Abcc8B2RUS7 1588 aa41.34■■■■■ 4.21
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Abcc9P70170 1546 aa41.22■■■■■ 4.19
Cldn3-201ENSMUST00000094245 ScribQ80U72 1612 aa40.2■■■■■ 4.03
Cldn3-201ENSMUST00000094245 NacadQ5SWP3 1504 aa38.81■■■■□ 3.8
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Kdm5dQ62240 1548 aa38.75■■■■□ 3.79
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Sycp2Q9CUU3 1500 aa38.07■■■■□ 3.69
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Dcaf1Q80TR8 1506 aa37.92■■■■□ 3.66
Cldn3-201ENSMUST00000094245 BicraF8VPZ9 1578 aa37.65■■■■□ 3.62
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa37.3■■■■□ 3.56
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa37.16■■■■□ 3.54
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Baz1aO88379 1555 aa36.57■■■■□ 3.44
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ccdc180J3QNE4 1664 aa36.42■■■■□ 3.42
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rhox8Q6VSS7 320 aa36.4■■■■□ 3.42
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Crybg2B7ZCC2 1516 aa36.39■■■■□ 3.42
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa35.98■■■■□ 3.35
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ercc6F8VPZ5 1481 aa35.93■■■■□ 3.34
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35.79■■■■□ 3.32
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa35.67■■■■□ 3.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fam135aQ6NS59 1506 aa35.65■■■■□ 3.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa35.54■■■■□ 3.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Wdr62Q3U3T8 1523 aa35.43■■■■□ 3.26
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Frmpd1A2AKB4 1549 aa35.37■■■■□ 3.25
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Baz1bQ9Z277 1479 aa35.15■■■■□ 3.22
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ubl4bQ9CQ84 188 aa34.94■■■■□ 3.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Unc13aQ4KUS2 1712 aa34.89■■■■□ 3.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Mrc2Q64449 1479 aa34.82■■■■□ 3.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34.63■■■■□ 3.13
Cldn3-201ENSMUST00000094245 CftrP26361 1476 aa34.63■■■■□ 3.13
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Synj1Q8CHC4 1574 aa34.54■■■■□ 3.12
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rtl1Q7M732 1744 aa34.5■■■■□ 3.11
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Trim41Q5NCC3 630 aa34.21■■■■□ 3.07
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Dnajc5P60904 198 aa34.18■■■■□ 3.06
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa34.15■■■■□ 3.06
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa34.12■■■■□ 3.05
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cux2P70298 1426 aa34.04■■■■□ 3.04
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Kif15Q6P9L6 1387 aa33.97■■■■□ 3.03
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Kif21aQ9QXL2 1672 aa33.93■■■■□ 3.02
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Lamc3Q9R0B6 1581 aa33.72■■■□□ 2.99
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cep164Q5DU05 1446 aa33.49■■■□□ 2.95
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Shroom2A2ALU4 1481 aa33.44■■■□□ 2.94
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Plb1Q3TTY0 1478 aa33.27■■■□□ 2.92
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ccdc18Q640L5 1455 aa33.25■■■□□ 2.91
Cldn3-201ENSMUST00000094245 TnnQ80Z71 1560 aa33.23■■■□□ 2.91
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Il27Q8K3I6 234 aa33.23■■■□□ 2.91
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Crocc2F6XLV1 1638 aa33.15■■■□□ 2.9
Cldn3-201ENSMUST00000094245 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Camsap1A2AHC3 1581 aa33.11■■■□□ 2.89
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Top2bQ64511 1612 aa33.07■■■□□ 2.88
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Col17a1Q07563 1470 aa33.06■■■□□ 2.88
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Golga3P55937 1487 aa33.03■■■□□ 2.88
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rusc2Q80U22 1514 aa32.96■■■□□ 2.87
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cngb1E1AZ71 1325 aa32.94■■■□□ 2.86
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ift140E9PY46 1464 aa32.93■■■□□ 2.86
Cldn3-201ENSMUST00000094245 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.84
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fmn1Q05860 1466 aa32.76■■■□□ 2.84
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Duox2A2AQ99 1517 aa32.74■■■□□ 2.83
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Disp1Q3TDN0 1521 aa32.62■■■□□ 2.81
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Grin2bQ01097 1482 aa32.6■■■□□ 2.81
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Samd9lQ69Z37 1561 aa32.53■■■□□ 2.8
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa32.46■■■□□ 2.79
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Setd1bQ8CFT2 1985 aa32.45■■■□□ 2.79
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Efcab5A0JP43 1406 aa32.34■■■□□ 2.77
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rad54l2Q99NG0 1466 aa32.3■■■□□ 2.76
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Grin2aP35436 1464 aa32.26■■■□□ 2.75
Cldn3-201ENSMUST00000094245 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Adgrl3Q80TS3 1537 aa32.25■■■□□ 2.75
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Magi3Q9EQJ9 1476 aa32.23■■■□□ 2.75
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fgd6Q69ZL1 1399 aa32.19■■■□□ 2.74
Cldn3-201ENSMUST00000094245 PtprkP35822 1457 aa32.18■■■□□ 2.74
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cep170Q6A065 1588 aa32.18■■■□□ 2.74
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa32.16■■■□□ 2.74
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa32.14■■■□□ 2.74
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa32.09■■■□□ 2.73
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa32.07■■■□□ 2.72
Cldn3-201ENSMUST00000094245 NrkQ9R0G8 1455 aa32.07■■■□□ 2.72
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa32.04■■■□□ 2.72
Cldn3-201ENSMUST00000094245 AknaQ80VW7 1404 aa32.02■■■□□ 2.72
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gm156Q58A37 223 aa32.02■■■□□ 2.72
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Pla2r1Q62028 1487 aa31.99■■■□□ 2.71
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