RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034876.9

Tspan3-201, Transcript of Tetraspanin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tspan3, Length 1,716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ubn2Q80WC1 1314 aa31.29■■■□□ 2.6
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rhot2Q8JZN7 620 aa31.28■■■□□ 2.6
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Lrp5Q91VN0 1614 aa31.28■■■□□ 2.6
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dbndd1Q9CZ00 160 aa31.27■■■□□ 2.6
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zfyve9A2A8R0 1397 aa31.27■■■□□ 2.6
Tspan3-201ENSMUST00000034876 ArxO35085 564 aa31.27■■■□□ 2.6
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Col22a1E9Q7P1 1613 aa31.26■■■□□ 2.6
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Duox1A2AQ92 1551 aa31.26■■■□□ 2.6
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Bin2D3Z6Q9 489 aa31.26■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Sptbn5F6UCX4 1208 aa31.26■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Nphp3Q7TNH6 1325 aa31.25■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm10093D3YYI8 482 aa31.25■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mctp2Q5RJH2 878 aa31.25■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Asap2Q7SIG6 958 aa31.24■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 MpndQ3TV65 487 aa31.24■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa31.24■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Plcd4Q8K3R3 807 aa31.24■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tmem266Q8BZB3 538 aa31.23■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tlr8P58682 1032 aa31.22■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Vps54Q5SPW0 977 aa31.22■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Plekho1Q9JIY0 408 aa31.22■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Col11a2Q64739 1736 aa31.22■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 EappQ5BU09 281 aa31.21■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa31.21■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 MeiocA2AG06 965 aa31.21■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rnf123Q5XPI3 1314 aa31.2■■■□□ 2.59
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Atp2b3Q0VF55 1220 aa31.2■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Plbd2Q3TCN2 594 aa31.2■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 VeztQ3ZK22 780 aa31.2■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Arid3aQ62431 601 aa31.19■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Slc4a1P04919 929 aa31.18■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Sumf1Q8R0F3 372 aa31.18■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gja10Q9WUS4 505 aa31.18■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa31.18■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Krt25Q8VCW2 446 aa31.18■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cfap44E9Q5M6 1843 aa31.17■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 TsksO54887 585 aa31.17■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Plekhf1Q3TB82 279 aa31.17■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Akt1s1Q9D1F4 257 aa31.17■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pde8bE9Q4S1 865 aa31.16■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Fam198bQ3UPI1 517 aa31.16■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Fbxo3Q9DC63 480 aa31.16■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Sh3bp5Q9Z131 463 aa31.16■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa31.15■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 NppbP40753 121 aa31.15■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Eva1cP58659 440 aa31.15■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Spata31d1bE9QA57 1361 aa31.14■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 ZyxQ62523 564 aa31.14■■■□□ 2.58
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Kcnq5Q9JK45 933 aa31.13■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ccne2Q9Z238 404 aa31.13■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ube4aE9Q735 1028 aa31.12■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ddx11Q6AXC6 880 aa31.12■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Fam84aQ9D650 292 aa31.12■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 1700029H14RikE9PY36 240 aa31.12■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Slc39a11Q8BWY7 342 aa31.12■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Top1mtQ8R4U6 593 aa31.12■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa31.11■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Golim4Q8BXA1 655 aa31.11■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa31.11■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 MccE9PWI3 1003 aa31.1■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 EngaseQ8BX80 734 aa31.1■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ift57Q8BXG3 429 aa31.1■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rdm1Q9CQK3 281 aa31.1■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Sept1P42209 366 aa31.1■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tmem143Q8VD26 458 aa31.1■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Popdc2Q9ES82 367 aa31.1■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Znf692Q3U381 531 aa31.09■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa31.09■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 CpzQ8R4V4 654 aa31.09■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 TnksQ6PFX9 1320 aa31.08■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tshz3Q8CGV9 1081 aa31.08■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mlh1Q9JK91 760 aa31.08■■■□□ 2.57
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mdm2P23804 489 aa31.07■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Jdp2P97875 163 aa31.07■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rad50P70388 1312 aa31.07■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zkscan16A2ALW2 728 aa31.07■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Speer4dL7N216 212 aa31.07■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Slurp2P0DP59 97 aa31.07■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Znf496Q5SXI5 585 aa31.07■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Sptlc3Q8BG54 563 aa31.07■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Lgr5Q9Z1P4 907 aa31.07■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Fam160b2Q80YR2 744 aa31.06■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Col3a1P08121 1464 aa31.06■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm7347D3YYI9 267 aa31.05■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Speer4aF8VPX6 267 aa31.05■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm4340L7N2C4 268 aa31.05■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Jakmip1Q8BVL9 626 aa31.05■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa31.04■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 NpeppsQ11011 920 aa31.04■■■□□ 2.56
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ms4a2P20490 235 aa31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 126 ms