RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568294.5

HDGFL3-206, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

TSL 4

Gene HDGFL3, Length 3,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-206ENST00000568294 FAM157BP0CG42 384 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 HPGDP15428 266 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 UGT2B7P16662 529 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 THBS2P35442 1172 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 PER3P56645 1201 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 PLA2G7Q13093 441 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 MELKQ14680 651 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 ZIC1Q15915 447 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 PLA1AQ53H76 456 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 EIPR1Q53HC9 387 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 LEG1Q6P5S2 330 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 SLC35F2Q8IXU6 374 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 TIMP4Q99727 224 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 DAPP1Q9UN19 280 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 CFAP54Q96N23 3096 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 H0YC42 278 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 GPR171O14626 319 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 IFNGP01579 166 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 LINC00271P0C7V0 271 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 ERGP11308 486 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 LCN1P31025 176 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 KIAA1024LP59773 190 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 PON3Q15166 354 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 GRK1Q15835 563 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 STPG1Q5TH74 334 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 TEX261Q6UWH6 196 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 NDUFAF7Q7L592 441 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 THEM6Q8WUY1 208 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 Q96M85 177 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 GAL3ST4Q96RP7 486 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 U3KQ87 197 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 B4DGG1 531 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 FGF19O95750 216 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 NID1P14543 1247 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 AQP2P41181 271 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 FNTBP49356 437 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 TMEM69Q5SWH9 247 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 FAM198BQ6UWH4 519 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 SLC35D2Q76EJ3 337 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 SYNPRQ8TBG9 265 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 SLC25A36Q96CQ1 311 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 TOX2Q96NM4 488 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 KCNJ15Q99712 375 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 TEX101Q9BY14 249 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 CMC2Q9NRP2 79 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 SPACA6W5XKT8 324 aa8.25□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 EPXP11678 715 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 HOXB2P14652 356 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 LSSP48449 732 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 GPM6BQ13491 265 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 GAS6Q14393 721 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 SLC36A2Q495M3 483 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 PARM1Q6UWI2 310 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 RTL4Q6ZR62 310 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 TRILQ7L0X0 811 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 CSNK1A1LQ8N752 337 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 OR6N2Q8NGY6 317 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 OR10AC1Q8NH08 325 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 C10orf90Q96M02 699 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 CA10Q9NS85 328 aa8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HDGFL3-206ENST00000568294 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms