RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531867.1

PUM1-222, Transcript of pumilio RNA binding family member 1, human

TSL 4

Gene PUM1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM1-222	ENST00000531867	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	GPR78	Q96P69	363 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	RASL10B	Q96S79	203 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	CCDC77	Q9BR77	488 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	YY1AP1	Q9H869	796 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	PROK2	Q9HC23	129 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867		Q9N2J8	555 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	EQTN	Q9NQ60	294 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	NLK	Q9UBE8	527 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	TAC3	Q9UHF0	121 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	SPACA6	W5XKT8	324 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	TG	P01266	2768 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867		G3V3Y1	287 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867		H0YIV9	168 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	TRIM77	I1YAP6	450 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	CHST10	O43529	356 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	CST8	O60676	142 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	RCBTB2	O95199	551 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	CCL3	P10147	92 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	MAOA	P21397	527 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	HRH2	P25021	359 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	PSMB4	P28070	264 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	IDUA	P35475	653 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	HSD17B2	P37059	387 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	CDKN2B	P42772	138 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	MTTP	P55157	894 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	DYNLT1	P63172	113 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	ACVR1	Q04771	509 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	VEZF1	Q14119	521 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	TFDP2	Q14188	446 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	HERC3	Q15034	1050 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	ZMYND11	Q15326	602 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	TMED2	Q15363	201 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	TEX38	Q6PEX7	206 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF534	Q76KX8	674 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	KRT222	Q8N1A0	295 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF611	Q8N823	705 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	OR8K3	Q8NH51	312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	AGR3	Q8TD06	166 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	NSMAF	Q92636	917 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	NCLN	Q969V3	563 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	BEX2	Q9BXY8	128 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	PIGM	Q9H3S5	423 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	EXO5	Q9H790	373 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	RMND5A	Q9H871	391 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	CRLF2	Q9HC73	371 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867		A0A087X0T9	212 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867		A0A1W2PPM1	405 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867		A8MUA0	341 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867		H0Y8G0	127 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	GPRIN2	O60269	458 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	B4GALT2	O60909	372 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867		P04436	131 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	FAM228B	P0C875	321 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
PUM1-222	ENST00000531867	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6

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