RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 CELP19835 753 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 NRG3P56975 720 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 ZPLD1Q8TCW7 415 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 NMNAT3Q96T66 252 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM43Q9BTV4 400 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 KATNB1Q9BVA0 655 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 ADGRL4Q9HBW9 690 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 MMP25Q9NPA2 562 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PQD3 144 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 DAPL1A0PJW8 107 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 FADS1O60427 444 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 LCN1P31025 176 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 SOX6P35712 828 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 SLC6A8P48029 635 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 LTBQ06643 244 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 SYT14Q8NB59 555 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 DUSP19Q8WTR2 217 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 TIMP4Q99727 224 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 TMED9Q9BVK6 235 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 ADAM19Q9H013 955 aa21.13■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 RPS5P46782 204 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 OR52N1Q8NH53 320 aa21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 LPAR4Q99677 370 aa21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 TTTY10Q9BZA0 68 aa21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 BARHL1Q9BZE3 327 aa21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 PALMDQ9NP74 551 aa21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 FGF5P12034 268 aa21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 FABP5Q01469 135 aa21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 TAAR8Q969N4 342 aa21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 NUAK2Q9H093 628 aa21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 ISYNA1Q9NPH2 558 aa21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 NRIP3Q9NQ35 241 aa21.12■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 SMIM30A4D0T7 59 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 OR6C70A6NIJ9 312 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 CDRT1O95170 752 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 SBK2P0C263 348 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 HCCSP53701 268 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 ATP1A4Q13733 1029 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 INSL4Q14641 139 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 C1QL3Q5VWW1 255 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 SLC43A2Q8N370 569 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 AGBL5Q8NDL9 886 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 OR5W2Q8NH69 310 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 ZNRF4Q8WWF5 429 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 SMPDL3BQ92485 455 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 JAM3Q9BX67 310 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 QPCTLQ9NXS2 382 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 SLC30A4O14863 429 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 F13BP05160 661 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 CXCR1P25024 350 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 GABRA5P31644 462 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 PRPS1P60891 318 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 BMPERQ8N8U9 685 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 TP53INP1Q96A56 240 aa21.11■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM200CA6NKL6 621 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 CLEC2LP0C7M8 214 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 IFITM3Q01628 133 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 IL11RAQ14626 422 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 RFLNBQ8N5W9 214 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 Q96M85 177 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 HDHD5Q9BXW7 423 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 FREM2Q5SZK8 3169 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 OR6C68A6NDL8 312 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 PGCP20142 388 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 S100A5P33763 92 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 MPLP40238 635 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 CBFBQ13951 182 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 QPRTQ15274 297 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 ARMC4Q5T2S8 1044 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 NPEPL1Q8NDH3 523 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 GALNT9Q9HCQ5 603 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 ASB6Q9NWX5 421 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 HIF3AQ9Y2N7 669 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 A3GALT2U3KPV4 340 aa21.1■□□□□ 0.97
FAAP20-209ENST00000428120 CTDSP2O14595 271 aa21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms