RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403915.5

KCNS3-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS3, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-202ENST00000403915 BPIFA2Q96DR5 249 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 TMEM19Q96HH6 336 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 TMEM74Q96NL1 305 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 CST1P01037 141 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 ELFN1P0C7U0 828 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 ACRP10323 421 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 TYRP14679 529 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 GGT1P19440 569 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 SLC6A2P23975 617 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 SLC6A4P31645 630 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 MC4RP32245 332 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 SDC2P34741 201 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 BTCP35070 178 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 SLC19A1P41440 591 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 RAP2BP61225 183 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 RBPJQ06330 500 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 TCTN3Q6NUS6 607 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 TMEM270Q6UE05 265 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 FAM151BQ6UXP7 276 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 OR2M7Q8NG81 312 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 OR7G2Q8NG99 324 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 KIF12Q96FN5 646 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 ABHD1Q96SE0 405 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 ULBP1Q9BZM6 244 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 MTG2Q9H4K7 406 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 UPB1Q9UBR1 384 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 KCNK6Q9Y257 313 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNS3-202ENST00000403915 A0A087WZY1 265 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 A0A1W2PR48 441 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 WDR27A2RRH5 827 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 SMIM30A4D0T7 59 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 SDHDO14521 159 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 GABRDO14764 452 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 RAMP3O60896 148 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 SCGNO76038 276 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 SLCO2B1O94956 709 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 HIST1H2ABP04908 130 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 HOXB7P09629 217 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 ARAFP10398 606 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 NID1P14543 1247 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 HTR2CP28335 458 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 RPL22P35268 128 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 CASP7P55210 303 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 OR4D1Q15615 310 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 RAB11BQ15907 218 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 BATFQ16520 125 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 UNC50Q53HI1 259 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 TM4SF20Q53R12 229 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 OR10K2Q6IF99 312 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 FAAP20Q6NZ36 180 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 LINC01551Q86U37 167 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 M1APQ8TC57 530 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 TAAR6Q96RI8 345 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 MGLLQ99685 303 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 SLC6A7Q99884 636 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNS3-202ENST00000403915 SLITRK2Q9H156 845 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms