RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC22O60826 627 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 NOL4O94818 638 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 VAMP5O95183 116 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 WDPCPO95876 746 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 TNNC2P02585 160 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 GSTA1P08263 222 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 MMP10P09238 476 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 RRASP10301 218 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 SAGP10523 405 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 PCMT1P22061 227 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 CA6P23280 308 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 DTYMKP23919 212 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 S100PP25815 95 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 TEAD1P28347 426 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 MAS1LP35410 378 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 PCK1P35558 622 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 MMP12P39900 470 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ATP5J2P56134 94 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 OR2B6P58173 313 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 FOLH1Q04609 750 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ARHGAP1Q07960 439 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 FGL1Q08830 312 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 NECTIN1Q15223 517 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 VAMP3Q15836 100 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 EXT1Q16394 746 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 LRRC36Q1X8D7 754 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 TRIM16LQ309B1 348 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 HLA-BQ31612 363 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 CHRFAM7AQ494W8 412 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 LIN52Q52LA3 116 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 PHLDA2Q53GA4 152 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 CTSL3PQ5NE16 218 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ACER2Q5QJU3 275 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 LIPJQ5W064 366 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ADNP2Q6IQ32 1131 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ZFP1Q6P2D0 407 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 CBLN3Q6UW01 205 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 FAM198BQ6UWH4 519 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 SSX9Q7RTT3 188 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 SMIM15Q7Z3B0 74 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 C16orf62Q7Z3J2 963 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 SCD5Q86SK9 330 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ANKRD46Q86W74 232 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 HOGA1Q86XE5 327 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 TMEM139Q8IV31 216 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 FBXO39Q8N4B4 442 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 OR4D6Q8NGJ1 314 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ACTL9Q8TC94 416 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 BORCS5Q969J3 196 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 COQ2Q96H96 371 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 TSSK3Q96PN8 268 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 CCT8L2Q96SF2 557 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF559Q9BR84 538 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 SPATC1LQ9H0A9 340 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 SLC38A1Q9H2H9 487 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 OR51M1Q9H341 326 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 KCNK15Q9H427 330 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 SMYD3Q9H7B4 428 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 CD209Q9NNX6 404 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 NLGN3Q9NZ94 848 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ABCD2Q9UBJ2 740 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 BTNL2Q9UIR0 455 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 MOB4Q9Y3A3 225 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 AKAP12Q02952 1782 aa2.59□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 WNK3Q9BYP7 1800 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 RTL1A6NKG5 1358 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 NAV1Q8NEY1 1877 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 BCL9O00512 1426 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ERCC6Q03468 1493 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 FABP12A6NFH5 140 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 MSGN1A6NI15 193 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 EFCAB7A8K855 629 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 TCAPO15273 167 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 MED6O75586 246 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 OR2F2O95006 317 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 LINC00614P0C842 121 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 OCM2P0CE71 109 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 PSKH1P11801 424 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 ADRB3P13945 408 aa2.58□□□□□ -2
GPBP1-201ENST00000264779 RAB3AP20336 220 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms